Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W9

Gria3, Glutamate receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria3Q9Z2W9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gria3Q9Z2W9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gria3Q9Z2W9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Gria3Q9Z2W9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gria3Q9Z2W9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gria3Q9Z2W9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gria3Q9Z2W9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gria3Q9Z2W9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gria3Q9Z2W9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gria3Q9Z2W9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gria3Q9Z2W9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gria3Q9Z2W9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gria3Q9Z2W9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gria3Q9Z2W9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gria3Q9Z2W9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gria3Q9Z2W9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gria3Q9Z2W9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gria3Q9Z2W9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gria3Q9Z2W9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Gria3Q9Z2W9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gria3Q9Z2W9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gria3Q9Z2W9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gria3Q9Z2W9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Gria3Q9Z2W9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gria3Q9Z2W9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gria3Q9Z2W9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gria3Q9Z2W9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gria3Q9Z2W9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gria3Q9Z2W9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gria3Q9Z2W9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gria3Q9Z2W9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gria3Q9Z2W9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gria3Q9Z2W9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gria3Q9Z2W9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gria3Q9Z2W9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gria3Q9Z2W9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gria3Q9Z2W9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gria3Q9Z2W9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gria3Q9Z2W9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gria3Q9Z2W9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gria3Q9Z2W9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gria3Q9Z2W9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gria3Q9Z2W9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gria3Q9Z2W9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gria3Q9Z2W9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gria3Q9Z2W9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gria3Q9Z2W9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gria3Q9Z2W9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gria3Q9Z2W9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gria3Q9Z2W9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Gria3Q9Z2W9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gria3Q9Z2W9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gria3Q9Z2W9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gria3Q9Z2W9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gria3Q9Z2W9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gria3Q9Z2W9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gria3Q9Z2W9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gria3Q9Z2W9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gria3Q9Z2W9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gria3Q9Z2W9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gria3Q9Z2W9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gria3Q9Z2W9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gria3Q9Z2W9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gria3Q9Z2W9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gria3Q9Z2W9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gria3Q9Z2W9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gria3Q9Z2W9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gria3Q9Z2W9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gria3Q9Z2W9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gria3Q9Z2W9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gria3Q9Z2W9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gria3Q9Z2W9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gria3Q9Z2W9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gria3Q9Z2W9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gria3Q9Z2W9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gria3Q9Z2W9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gria3Q9Z2W9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gria3Q9Z2W9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gria3Q9Z2W9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gria3Q9Z2W9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gria3Q9Z2W9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gria3Q9Z2W9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gria3Q9Z2W9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gria3Q9Z2W9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gria3Q9Z2W9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gria3Q9Z2W9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gria3Q9Z2W9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gria3Q9Z2W9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gria3Q9Z2W9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gria3Q9Z2W9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gria3Q9Z2W9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gria3Q9Z2W9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gria3Q9Z2W9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gria3Q9Z2W9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gria3Q9Z2W9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gria3Q9Z2W9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gria3Q9Z2W9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gria3Q9Z2W9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gria3Q9Z2W9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gria3Q9Z2W9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms