Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Ap3b1Q9Z1T1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Ap3b1Q9Z1T1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
Ap3b1Q9Z1T1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.74
Ap3b1Q9Z1T1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Ap3b1Q9Z1T1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Ap3b1Q9Z1T1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Ap3b1Q9Z1T1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Ap3b1Q9Z1T1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Ap3b1Q9Z1T1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Ap3b1Q9Z1T1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Ap3b1Q9Z1T1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Ap3b1Q9Z1T1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
Ap3b1Q9Z1T1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Ap3b1Q9Z1T1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Ap3b1Q9Z1T1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.71
Ap3b1Q9Z1T1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Ap3b1Q9Z1T1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
Ap3b1Q9Z1T1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Ap3b1Q9Z1T1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Ap3b1Q9Z1T1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Ap3b1Q9Z1T1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Ap3b1Q9Z1T1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Ap3b1Q9Z1T1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Ap3b1Q9Z1T1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
Ap3b1Q9Z1T1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Ap3b1Q9Z1T1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Ap3b1Q9Z1T1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Ap3b1Q9Z1T1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Ap3b1Q9Z1T1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Ap3b1Q9Z1T1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Ap3b1Q9Z1T1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Ap3b1Q9Z1T1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
Ap3b1Q9Z1T1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Ap3b1Q9Z1T1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Ap3b1Q9Z1T1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Ap3b1Q9Z1T1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Ap3b1Q9Z1T1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Ap3b1Q9Z1T1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Ap3b1Q9Z1T1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Ap3b1Q9Z1T1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Ap3b1Q9Z1T1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Ap3b1Q9Z1T1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Ap3b1Q9Z1T1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Ap3b1Q9Z1T1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Ap3b1Q9Z1T1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Ap3b1Q9Z1T1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Ap3b1Q9Z1T1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Ap3b1Q9Z1T1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Ap3b1Q9Z1T1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Ap3b1Q9Z1T1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Ap3b1Q9Z1T1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Ap3b1Q9Z1T1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Ap3b1Q9Z1T1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Ap3b1Q9Z1T1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Ap3b1Q9Z1T1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Ap3b1Q9Z1T1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Ap3b1Q9Z1T1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Ap3b1Q9Z1T1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Ap3b1Q9Z1T1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Ap3b1Q9Z1T1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Ap3b1Q9Z1T1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Ap3b1Q9Z1T1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
Ap3b1Q9Z1T1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Ap3b1Q9Z1T1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
Ap3b1Q9Z1T1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Ap3b1Q9Z1T1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
Ap3b1Q9Z1T1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Ap3b1Q9Z1T1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Ap3b1Q9Z1T1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Ap3b1Q9Z1T1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Ap3b1Q9Z1T1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Ap3b1Q9Z1T1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Ap3b1Q9Z1T1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Ap3b1Q9Z1T1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Ap3b1Q9Z1T1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Ap3b1Q9Z1T1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Ap3b1Q9Z1T1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Ap3b1Q9Z1T1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Ap3b1Q9Z1T1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Ap3b1Q9Z1T1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Ap3b1Q9Z1T1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Ap3b1Q9Z1T1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Ap3b1Q9Z1T1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Ap3b1Q9Z1T1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ap3b1Q9Z1T1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ap3b1Q9Z1T1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC37.76■■■■□ 3.64
Ap3b1Q9Z1T1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Ap3b1Q9Z1T1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms