Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z175

Loxl3, Lysyl oxidase homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Loxl3Q9Z175 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Loxl3Q9Z175 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Loxl3Q9Z175 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Loxl3Q9Z175 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Loxl3Q9Z175 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Loxl3Q9Z175 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Loxl3Q9Z175 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Loxl3Q9Z175 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Loxl3Q9Z175 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Loxl3Q9Z175 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Loxl3Q9Z175 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Loxl3Q9Z175 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Loxl3Q9Z175 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Loxl3Q9Z175 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Loxl3Q9Z175 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Loxl3Q9Z175 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Loxl3Q9Z175 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Loxl3Q9Z175 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Loxl3Q9Z175 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Loxl3Q9Z175 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Loxl3Q9Z175 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Loxl3Q9Z175 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Loxl3Q9Z175 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Loxl3Q9Z175 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Loxl3Q9Z175 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Loxl3Q9Z175 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Loxl3Q9Z175 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Loxl3Q9Z175 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Loxl3Q9Z175 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Loxl3Q9Z175 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Loxl3Q9Z175 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Loxl3Q9Z175 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Loxl3Q9Z175 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Loxl3Q9Z175 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Loxl3Q9Z175 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Loxl3Q9Z175 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Loxl3Q9Z175 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Loxl3Q9Z175 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Loxl3Q9Z175 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Loxl3Q9Z175 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Loxl3Q9Z175 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Loxl3Q9Z175 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Loxl3Q9Z175 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Loxl3Q9Z175 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Loxl3Q9Z175 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Loxl3Q9Z175 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Loxl3Q9Z175 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Loxl3Q9Z175 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Loxl3Q9Z175 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Loxl3Q9Z175 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Loxl3Q9Z175 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Loxl3Q9Z175 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Loxl3Q9Z175 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Loxl3Q9Z175 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Loxl3Q9Z175 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Loxl3Q9Z175 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Loxl3Q9Z175 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Loxl3Q9Z175 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Loxl3Q9Z175 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Loxl3Q9Z175 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Loxl3Q9Z175 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Loxl3Q9Z175 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Loxl3Q9Z175 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Loxl3Q9Z175 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Loxl3Q9Z175 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Loxl3Q9Z175 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Loxl3Q9Z175 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Loxl3Q9Z175 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Loxl3Q9Z175 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Loxl3Q9Z175 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Loxl3Q9Z175 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Loxl3Q9Z175 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Loxl3Q9Z175 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Loxl3Q9Z175 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Loxl3Q9Z175 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Loxl3Q9Z175 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Loxl3Q9Z175 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Loxl3Q9Z175 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Loxl3Q9Z175 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Loxl3Q9Z175 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Loxl3Q9Z175 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Loxl3Q9Z175 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Loxl3Q9Z175 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Loxl3Q9Z175 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Loxl3Q9Z175 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Loxl3Q9Z175 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Loxl3Q9Z175 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Loxl3Q9Z175 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Loxl3Q9Z175 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Loxl3Q9Z175 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Loxl3Q9Z175 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Loxl3Q9Z175 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Loxl3Q9Z175 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Loxl3Q9Z175 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Loxl3Q9Z175 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Loxl3Q9Z175 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Loxl3Q9Z175 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Loxl3Q9Z175 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Loxl3Q9Z175 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Loxl3Q9Z175 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms