Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cpne6Q9Z140 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cpne6Q9Z140 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cpne6Q9Z140 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cpne6Q9Z140 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cpne6Q9Z140 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cpne6Q9Z140 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cpne6Q9Z140 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cpne6Q9Z140 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cpne6Q9Z140 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cpne6Q9Z140 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cpne6Q9Z140 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cpne6Q9Z140 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cpne6Q9Z140 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cpne6Q9Z140 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cpne6Q9Z140 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cpne6Q9Z140 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cpne6Q9Z140 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cpne6Q9Z140 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cpne6Q9Z140 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cpne6Q9Z140 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cpne6Q9Z140 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cpne6Q9Z140 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cpne6Q9Z140 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cpne6Q9Z140 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cpne6Q9Z140 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cpne6Q9Z140 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cpne6Q9Z140 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cpne6Q9Z140 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cpne6Q9Z140 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cpne6Q9Z140 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cpne6Q9Z140 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cpne6Q9Z140 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cpne6Q9Z140 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cpne6Q9Z140 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cpne6Q9Z140 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cpne6Q9Z140 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cpne6Q9Z140 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cpne6Q9Z140 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cpne6Q9Z140 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cpne6Q9Z140 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cpne6Q9Z140 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cpne6Q9Z140 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cpne6Q9Z140 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cpne6Q9Z140 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cpne6Q9Z140 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpne6Q9Z140 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpne6Q9Z140 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cpne6Q9Z140 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cpne6Q9Z140 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cpne6Q9Z140 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cpne6Q9Z140 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cpne6Q9Z140 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpne6Q9Z140 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpne6Q9Z140 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpne6Q9Z140 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpne6Q9Z140 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpne6Q9Z140 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpne6Q9Z140 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpne6Q9Z140 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpne6Q9Z140 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpne6Q9Z140 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cpne6Q9Z140 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cpne6Q9Z140 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpne6Q9Z140 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpne6Q9Z140 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpne6Q9Z140 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpne6Q9Z140 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cpne6Q9Z140 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cpne6Q9Z140 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cpne6Q9Z140 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cpne6Q9Z140 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpne6Q9Z140 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpne6Q9Z140 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpne6Q9Z140 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpne6Q9Z140 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpne6Q9Z140 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cpne6Q9Z140 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cpne6Q9Z140 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cpne6Q9Z140 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cpne6Q9Z140 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cpne6Q9Z140 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cpne6Q9Z140 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cpne6Q9Z140 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpne6Q9Z140 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpne6Q9Z140 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpne6Q9Z140 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpne6Q9Z140 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cpne6Q9Z140 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cpne6Q9Z140 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cpne6Q9Z140 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cpne6Q9Z140 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpne6Q9Z140 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpne6Q9Z140 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpne6Q9Z140 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpne6Q9Z140 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpne6Q9Z140 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpne6Q9Z140 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpne6Q9Z140 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpne6Q9Z140 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms