Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Ap4s1Q9WVL1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Ap4s1Q9WVL1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Ap4s1Q9WVL1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23,16■■□□□ 1,3
Ap4s1Q9WVL1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,16■■□□□ 1,3
Ap4s1Q9WVL1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23,16■■□□□ 1,3
Ap4s1Q9WVL1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Ap4s1Q9WVL1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Ap4s1Q9WVL1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
Ap4s1Q9WVL1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Ap4s1Q9WVL1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23,13■■□□□ 1,29
Ap4s1Q9WVL1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Ap4s1Q9WVL1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Ap4s1Q9WVL1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23,12■■□□□ 1,29
Ap4s1Q9WVL1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23,11■■□□□ 1,29
Ap4s1Q9WVL1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23,11■■□□□ 1,29
Ap4s1Q9WVL1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23,11■■□□□ 1,29
Ap4s1Q9WVL1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Ap4s1Q9WVL1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Ap4s1Q9WVL1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Ap4s1Q9WVL1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Ap4s1Q9WVL1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Ap4s1Q9WVL1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23,09■■□□□ 1,29
Ap4s1Q9WVL1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23,09■■□□□ 1,29
Ap4s1Q9WVL1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23,09■■□□□ 1,29
Ap4s1Q9WVL1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Ap4s1Q9WVL1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Ap4s1Q9WVL1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23,08■■□□□ 1,29
Ap4s1Q9WVL1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,28
Ap4s1Q9WVL1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,08■■□□□ 1,28
Ap4s1Q9WVL1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Ap4s1Q9WVL1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Ap4s1Q9WVL1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Ap4s1Q9WVL1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Ap4s1Q9WVL1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Ap4s1Q9WVL1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,05■■□□□ 1,28
Ap4s1Q9WVL1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Ap4s1Q9WVL1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Ap4s1Q9WVL1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Ap4s1Q9WVL1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23,03■■□□□ 1,28
Ap4s1Q9WVL1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Ap4s1Q9WVL1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Ap4s1Q9WVL1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Ap4s1Q9WVL1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Ap4s1Q9WVL1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Ap4s1Q9WVL1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Ap4s1Q9WVL1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,99■■□□□ 1,27
Ap4s1Q9WVL1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Ap4s1Q9WVL1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Ap4s1Q9WVL1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Ap4s1Q9WVL1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Ap4s1Q9WVL1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Ap4s1Q9WVL1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22,96■■□□□ 1,27
Ap4s1Q9WVL1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Ap4s1Q9WVL1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,95■■□□□ 1,27
Ap4s1Q9WVL1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Ap4s1Q9WVL1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Ap4s1Q9WVL1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Ap4s1Q9WVL1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Ap4s1Q9WVL1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Ap4s1Q9WVL1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Ap4s1Q9WVL1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Ap4s1Q9WVL1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,93■■□□□ 1,26
Ap4s1Q9WVL1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Ap4s1Q9WVL1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Ap4s1Q9WVL1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Ap4s1Q9WVL1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Ap4s1Q9WVL1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Ap4s1Q9WVL1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Ap4s1Q9WVL1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Ap4s1Q9WVL1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Ap4s1Q9WVL1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Ap4s1Q9WVL1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Ap4s1Q9WVL1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22,91■■□□□ 1,26
Ap4s1Q9WVL1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Ap4s1Q9WVL1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22,91■■□□□ 1,26
Ap4s1Q9WVL1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Ap4s1Q9WVL1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,26
Ap4s1Q9WVL1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22,88■■□□□ 1,25
Ap4s1Q9WVL1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Ap4s1Q9WVL1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Ap4s1Q9WVL1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22,88■■□□□ 1,25
Ap4s1Q9WVL1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Ap4s1Q9WVL1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Ap4s1Q9WVL1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Ap4s1Q9WVL1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Ap4s1Q9WVL1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22,86■■□□□ 1,25
Ap4s1Q9WVL1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Ap4s1Q9WVL1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Ap4s1Q9WVL1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22,85■■□□□ 1,25
Ap4s1Q9WVL1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,85■■□□□ 1,25
Ap4s1Q9WVL1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Ap4s1Q9WVL1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Ap4s1Q9WVL1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Ap4s1Q9WVL1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
Ap4s1Q9WVL1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,83■■□□□ 1,24
Ap4s1Q9WVL1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,24
Ap4s1Q9WVL1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,83■■□□□ 1,24
Ap4s1Q9WVL1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Ap4s1Q9WVL1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22,81■■□□□ 1,24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22,6 ms