Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ptpn4Q9WU22 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptpn4Q9WU22 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptpn4Q9WU22 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptpn4Q9WU22 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ptpn4Q9WU22 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ptpn4Q9WU22 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ptpn4Q9WU22 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ptpn4Q9WU22 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptpn4Q9WU22 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptpn4Q9WU22 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptpn4Q9WU22 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptpn4Q9WU22 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptpn4Q9WU22 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptpn4Q9WU22 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptpn4Q9WU22 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptpn4Q9WU22 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptpn4Q9WU22 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptpn4Q9WU22 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptpn4Q9WU22 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptpn4Q9WU22 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptpn4Q9WU22 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ptpn4Q9WU22 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ptpn4Q9WU22 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ptpn4Q9WU22 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ptpn4Q9WU22 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptpn4Q9WU22 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptpn4Q9WU22 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptpn4Q9WU22 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptpn4Q9WU22 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptpn4Q9WU22 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptpn4Q9WU22 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptpn4Q9WU22 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ptpn4Q9WU22 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ptpn4Q9WU22 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ptpn4Q9WU22 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ptpn4Q9WU22 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptpn4Q9WU22 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptpn4Q9WU22 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptpn4Q9WU22 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptpn4Q9WU22 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptpn4Q9WU22 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptpn4Q9WU22 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptpn4Q9WU22 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptpn4Q9WU22 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptpn4Q9WU22 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ptpn4Q9WU22 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ptpn4Q9WU22 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ptpn4Q9WU22 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptpn4Q9WU22 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptpn4Q9WU22 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ptpn4Q9WU22 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ptpn4Q9WU22 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ptpn4Q9WU22 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ptpn4Q9WU22 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptpn4Q9WU22 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptpn4Q9WU22 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptpn4Q9WU22 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ptpn4Q9WU22 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ptpn4Q9WU22 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptpn4Q9WU22 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptpn4Q9WU22 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptpn4Q9WU22 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ptpn4Q9WU22 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ptpn4Q9WU22 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ptpn4Q9WU22 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ptpn4Q9WU22 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ptpn4Q9WU22 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ptpn4Q9WU22 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ptpn4Q9WU22 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptpn4Q9WU22 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptpn4Q9WU22 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptpn4Q9WU22 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptpn4Q9WU22 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptpn4Q9WU22 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptpn4Q9WU22 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptpn4Q9WU22 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpn4Q9WU22 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpn4Q9WU22 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpn4Q9WU22 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpn4Q9WU22 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpn4Q9WU22 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptpn4Q9WU22 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptpn4Q9WU22 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptpn4Q9WU22 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptpn4Q9WU22 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpn4Q9WU22 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpn4Q9WU22 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpn4Q9WU22 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpn4Q9WU22 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpn4Q9WU22 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpn4Q9WU22 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpn4Q9WU22 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpn4Q9WU22 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpn4Q9WU22 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptpn4Q9WU22 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptpn4Q9WU22 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptpn4Q9WU22 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptpn4Q9WU22 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpn4Q9WU22 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms