Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PADI4Q9UM07 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PADI4Q9UM07 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PADI4Q9UM07 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PADI4Q9UM07 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PADI4Q9UM07 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PADI4Q9UM07 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PADI4Q9UM07 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PADI4Q9UM07 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PADI4Q9UM07 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PADI4Q9UM07 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PADI4Q9UM07 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PADI4Q9UM07 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PADI4Q9UM07 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PADI4Q9UM07 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PADI4Q9UM07 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PADI4Q9UM07 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PADI4Q9UM07 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PADI4Q9UM07 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PADI4Q9UM07 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PADI4Q9UM07 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PADI4Q9UM07 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PADI4Q9UM07 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PADI4Q9UM07 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PADI4Q9UM07 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PADI4Q9UM07 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PADI4Q9UM07 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PADI4Q9UM07 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PADI4Q9UM07 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PADI4Q9UM07 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PADI4Q9UM07 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PADI4Q9UM07 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PADI4Q9UM07 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PADI4Q9UM07 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PADI4Q9UM07 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PADI4Q9UM07 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PADI4Q9UM07 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PADI4Q9UM07 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PADI4Q9UM07 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PADI4Q9UM07 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PADI4Q9UM07 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PADI4Q9UM07 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PADI4Q9UM07 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PADI4Q9UM07 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PADI4Q9UM07 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PADI4Q9UM07 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PADI4Q9UM07 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PADI4Q9UM07 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PADI4Q9UM07 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PADI4Q9UM07 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PADI4Q9UM07 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PADI4Q9UM07 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PADI4Q9UM07 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PADI4Q9UM07 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PADI4Q9UM07 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PADI4Q9UM07 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PADI4Q9UM07 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PADI4Q9UM07 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PADI4Q9UM07 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PADI4Q9UM07 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PADI4Q9UM07 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PADI4Q9UM07 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PADI4Q9UM07 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PADI4Q9UM07 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PADI4Q9UM07 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PADI4Q9UM07 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PADI4Q9UM07 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PADI4Q9UM07 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PADI4Q9UM07 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PADI4Q9UM07 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PADI4Q9UM07 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PADI4Q9UM07 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PADI4Q9UM07 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PADI4Q9UM07 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PADI4Q9UM07 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PADI4Q9UM07 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PADI4Q9UM07 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PADI4Q9UM07 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PADI4Q9UM07 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PADI4Q9UM07 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PADI4Q9UM07 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PADI4Q9UM07 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PADI4Q9UM07 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PADI4Q9UM07 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PADI4Q9UM07 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PADI4Q9UM07 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PADI4Q9UM07 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PADI4Q9UM07 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PADI4Q9UM07 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PADI4Q9UM07 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PADI4Q9UM07 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PADI4Q9UM07 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PADI4Q9UM07 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PADI4Q9UM07 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PADI4Q9UM07 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PADI4Q9UM07 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PADI4Q9UM07 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PADI4Q9UM07 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PADI4Q9UM07 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PADI4Q9UM07 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms