Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Slit2Q9R1B9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Slit2Q9R1B9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Slit2Q9R1B9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Slit2Q9R1B9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Slit2Q9R1B9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Slit2Q9R1B9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Slit2Q9R1B9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Slit2Q9R1B9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Slit2Q9R1B9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Slit2Q9R1B9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Slit2Q9R1B9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Slit2Q9R1B9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Slit2Q9R1B9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Slit2Q9R1B9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Slit2Q9R1B9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Slit2Q9R1B9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Slit2Q9R1B9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Slit2Q9R1B9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Slit2Q9R1B9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Slit2Q9R1B9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Slit2Q9R1B9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Slit2Q9R1B9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Slit2Q9R1B9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Slit2Q9R1B9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Slit2Q9R1B9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Slit2Q9R1B9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Slit2Q9R1B9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Slit2Q9R1B9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Slit2Q9R1B9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Slit2Q9R1B9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Slit2Q9R1B9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Slit2Q9R1B9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Slit2Q9R1B9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Slit2Q9R1B9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Slit2Q9R1B9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Slit2Q9R1B9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Slit2Q9R1B9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Slit2Q9R1B9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Slit2Q9R1B9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Slit2Q9R1B9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Slit2Q9R1B9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Slit2Q9R1B9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Slit2Q9R1B9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Slit2Q9R1B9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Slit2Q9R1B9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Slit2Q9R1B9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Slit2Q9R1B9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Slit2Q9R1B9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Slit2Q9R1B9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Slit2Q9R1B9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Slit2Q9R1B9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Slit2Q9R1B9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Slit2Q9R1B9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Slit2Q9R1B9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Slit2Q9R1B9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Slit2Q9R1B9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Slit2Q9R1B9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Slit2Q9R1B9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Slit2Q9R1B9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Slit2Q9R1B9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Slit2Q9R1B9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Slit2Q9R1B9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Slit2Q9R1B9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Slit2Q9R1B9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Slit2Q9R1B9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Slit2Q9R1B9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Slit2Q9R1B9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Slit2Q9R1B9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Slit2Q9R1B9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Slit2Q9R1B9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Slit2Q9R1B9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Slit2Q9R1B9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Slit2Q9R1B9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Slit2Q9R1B9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Slit2Q9R1B9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Slit2Q9R1B9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Slit2Q9R1B9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Slit2Q9R1B9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Slit2Q9R1B9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Slit2Q9R1B9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Slit2Q9R1B9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Slit2Q9R1B9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Slit2Q9R1B9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Slit2Q9R1B9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Slit2Q9R1B9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Slit2Q9R1B9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Slit2Q9R1B9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Slit2Q9R1B9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Slit2Q9R1B9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Slit2Q9R1B9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Slit2Q9R1B9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Slit2Q9R1B9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Slit2Q9R1B9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Slit2Q9R1B9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Slit2Q9R1B9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Slit2Q9R1B9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Slit2Q9R1B9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Slit2Q9R1B9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Slit2Q9R1B9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms