Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col4a3Q9QZS0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col4a3Q9QZS0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col4a3Q9QZS0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col4a3Q9QZS0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col4a3Q9QZS0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col4a3Q9QZS0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col4a3Q9QZS0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Col4a3Q9QZS0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col4a3Q9QZS0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Col4a3Q9QZS0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col4a3Q9QZS0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Col4a3Q9QZS0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Col4a3Q9QZS0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Col4a3Q9QZS0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Col4a3Q9QZS0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col4a3Q9QZS0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col4a3Q9QZS0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Col4a3Q9QZS0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col4a3Q9QZS0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col4a3Q9QZS0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col4a3Q9QZS0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col4a3Q9QZS0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col4a3Q9QZS0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col4a3Q9QZS0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Col4a3Q9QZS0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Col4a3Q9QZS0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Col4a3Q9QZS0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col4a3Q9QZS0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col4a3Q9QZS0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col4a3Q9QZS0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col4a3Q9QZS0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col4a3Q9QZS0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col4a3Q9QZS0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col4a3Q9QZS0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col4a3Q9QZS0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Col4a3Q9QZS0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col4a3Q9QZS0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col4a3Q9QZS0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Col4a3Q9QZS0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Col4a3Q9QZS0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Col4a3Q9QZS0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col4a3Q9QZS0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col4a3Q9QZS0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col4a3Q9QZS0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col4a3Q9QZS0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col4a3Q9QZS0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Col4a3Q9QZS0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col4a3Q9QZS0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col4a3Q9QZS0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col4a3Q9QZS0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col4a3Q9QZS0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col4a3Q9QZS0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col4a3Q9QZS0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Col4a3Q9QZS0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col4a3Q9QZS0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col4a3Q9QZS0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col4a3Q9QZS0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col4a3Q9QZS0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col4a3Q9QZS0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col4a3Q9QZS0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col4a3Q9QZS0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col4a3Q9QZS0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Col4a3Q9QZS0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Col4a3Q9QZS0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Col4a3Q9QZS0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Col4a3Q9QZS0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Col4a3Q9QZS0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col4a3Q9QZS0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col4a3Q9QZS0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Col4a3Q9QZS0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Col4a3Q9QZS0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Col4a3Q9QZS0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col4a3Q9QZS0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col4a3Q9QZS0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Col4a3Q9QZS0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col4a3Q9QZS0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col4a3Q9QZS0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col4a3Q9QZS0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col4a3Q9QZS0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col4a3Q9QZS0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Col4a3Q9QZS0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Col4a3Q9QZS0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Col4a3Q9QZS0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Col4a3Q9QZS0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col4a3Q9QZS0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col4a3Q9QZS0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col4a3Q9QZS0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col4a3Q9QZS0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Col4a3Q9QZS0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col4a3Q9QZS0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col4a3Q9QZS0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col4a3Q9QZS0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col4a3Q9QZS0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Col4a3Q9QZS0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col4a3Q9QZS0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col4a3Q9QZS0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms