Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clcf1Q9QZM3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Clcf1Q9QZM3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clcf1Q9QZM3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clcf1Q9QZM3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clcf1Q9QZM3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clcf1Q9QZM3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clcf1Q9QZM3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clcf1Q9QZM3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clcf1Q9QZM3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clcf1Q9QZM3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clcf1Q9QZM3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Clcf1Q9QZM3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clcf1Q9QZM3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clcf1Q9QZM3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clcf1Q9QZM3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Clcf1Q9QZM3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clcf1Q9QZM3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Clcf1Q9QZM3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clcf1Q9QZM3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clcf1Q9QZM3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clcf1Q9QZM3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clcf1Q9QZM3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clcf1Q9QZM3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clcf1Q9QZM3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clcf1Q9QZM3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clcf1Q9QZM3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clcf1Q9QZM3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Clcf1Q9QZM3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clcf1Q9QZM3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clcf1Q9QZM3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clcf1Q9QZM3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clcf1Q9QZM3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clcf1Q9QZM3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clcf1Q9QZM3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clcf1Q9QZM3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clcf1Q9QZM3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clcf1Q9QZM3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clcf1Q9QZM3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clcf1Q9QZM3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clcf1Q9QZM3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clcf1Q9QZM3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Clcf1Q9QZM3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clcf1Q9QZM3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clcf1Q9QZM3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clcf1Q9QZM3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clcf1Q9QZM3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clcf1Q9QZM3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clcf1Q9QZM3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clcf1Q9QZM3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clcf1Q9QZM3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clcf1Q9QZM3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clcf1Q9QZM3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clcf1Q9QZM3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Clcf1Q9QZM3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clcf1Q9QZM3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clcf1Q9QZM3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clcf1Q9QZM3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clcf1Q9QZM3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clcf1Q9QZM3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clcf1Q9QZM3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clcf1Q9QZM3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clcf1Q9QZM3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clcf1Q9QZM3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clcf1Q9QZM3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clcf1Q9QZM3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clcf1Q9QZM3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clcf1Q9QZM3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clcf1Q9QZM3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clcf1Q9QZM3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Clcf1Q9QZM3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Clcf1Q9QZM3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clcf1Q9QZM3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clcf1Q9QZM3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clcf1Q9QZM3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clcf1Q9QZM3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clcf1Q9QZM3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clcf1Q9QZM3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clcf1Q9QZM3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Clcf1Q9QZM3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clcf1Q9QZM3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clcf1Q9QZM3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clcf1Q9QZM3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clcf1Q9QZM3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clcf1Q9QZM3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clcf1Q9QZM3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clcf1Q9QZM3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clcf1Q9QZM3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clcf1Q9QZM3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clcf1Q9QZM3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clcf1Q9QZM3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clcf1Q9QZM3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clcf1Q9QZM3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clcf1Q9QZM3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clcf1Q9QZM3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clcf1Q9QZM3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clcf1Q9QZM3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clcf1Q9QZM3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clcf1Q9QZM3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clcf1Q9QZM3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms