Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snai3Q9QY31 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snai3Q9QY31 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snai3Q9QY31 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snai3Q9QY31 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snai3Q9QY31 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snai3Q9QY31 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snai3Q9QY31 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snai3Q9QY31 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Snai3Q9QY31 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snai3Q9QY31 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snai3Q9QY31 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snai3Q9QY31 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snai3Q9QY31 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snai3Q9QY31 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snai3Q9QY31 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snai3Q9QY31 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snai3Q9QY31 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snai3Q9QY31 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snai3Q9QY31 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Snai3Q9QY31 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snai3Q9QY31 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snai3Q9QY31 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snai3Q9QY31 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snai3Q9QY31 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snai3Q9QY31 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snai3Q9QY31 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snai3Q9QY31 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snai3Q9QY31 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snai3Q9QY31 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Snai3Q9QY31 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snai3Q9QY31 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snai3Q9QY31 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snai3Q9QY31 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snai3Q9QY31 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snai3Q9QY31 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snai3Q9QY31 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snai3Q9QY31 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snai3Q9QY31 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snai3Q9QY31 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snai3Q9QY31 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snai3Q9QY31 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snai3Q9QY31 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snai3Q9QY31 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snai3Q9QY31 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snai3Q9QY31 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snai3Q9QY31 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snai3Q9QY31 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snai3Q9QY31 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snai3Q9QY31 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snai3Q9QY31 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snai3Q9QY31 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snai3Q9QY31 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snai3Q9QY31 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snai3Q9QY31 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snai3Q9QY31 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snai3Q9QY31 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snai3Q9QY31 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snai3Q9QY31 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snai3Q9QY31 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snai3Q9QY31 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snai3Q9QY31 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snai3Q9QY31 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snai3Q9QY31 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snai3Q9QY31 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snai3Q9QY31 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snai3Q9QY31 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snai3Q9QY31 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snai3Q9QY31 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snai3Q9QY31 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snai3Q9QY31 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snai3Q9QY31 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snai3Q9QY31 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snai3Q9QY31 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snai3Q9QY31 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snai3Q9QY31 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snai3Q9QY31 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snai3Q9QY31 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snai3Q9QY31 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snai3Q9QY31 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snai3Q9QY31 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snai3Q9QY31 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snai3Q9QY31 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snai3Q9QY31 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snai3Q9QY31 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snai3Q9QY31 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snai3Q9QY31 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snai3Q9QY31 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snai3Q9QY31 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snai3Q9QY31 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snai3Q9QY31 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snai3Q9QY31 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snai3Q9QY31 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snai3Q9QY31 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snai3Q9QY31 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snai3Q9QY31 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snai3Q9QY31 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snai3Q9QY31 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Snai3Q9QY31 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snai3Q9QY31 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms