Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC3

Msrb1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb1Q9JLC3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msrb1Q9JLC3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msrb1Q9JLC3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msrb1Q9JLC3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msrb1Q9JLC3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msrb1Q9JLC3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msrb1Q9JLC3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msrb1Q9JLC3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msrb1Q9JLC3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msrb1Q9JLC3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msrb1Q9JLC3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msrb1Q9JLC3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Msrb1Q9JLC3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Msrb1Q9JLC3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msrb1Q9JLC3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msrb1Q9JLC3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msrb1Q9JLC3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msrb1Q9JLC3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msrb1Q9JLC3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msrb1Q9JLC3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Msrb1Q9JLC3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msrb1Q9JLC3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msrb1Q9JLC3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msrb1Q9JLC3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msrb1Q9JLC3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msrb1Q9JLC3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msrb1Q9JLC3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msrb1Q9JLC3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msrb1Q9JLC3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msrb1Q9JLC3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msrb1Q9JLC3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msrb1Q9JLC3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msrb1Q9JLC3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msrb1Q9JLC3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msrb1Q9JLC3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msrb1Q9JLC3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msrb1Q9JLC3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msrb1Q9JLC3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msrb1Q9JLC3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msrb1Q9JLC3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msrb1Q9JLC3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msrb1Q9JLC3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msrb1Q9JLC3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msrb1Q9JLC3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msrb1Q9JLC3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msrb1Q9JLC3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msrb1Q9JLC3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msrb1Q9JLC3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msrb1Q9JLC3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Msrb1Q9JLC3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msrb1Q9JLC3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msrb1Q9JLC3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msrb1Q9JLC3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msrb1Q9JLC3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msrb1Q9JLC3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msrb1Q9JLC3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msrb1Q9JLC3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msrb1Q9JLC3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msrb1Q9JLC3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msrb1Q9JLC3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msrb1Q9JLC3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msrb1Q9JLC3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msrb1Q9JLC3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msrb1Q9JLC3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msrb1Q9JLC3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msrb1Q9JLC3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msrb1Q9JLC3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msrb1Q9JLC3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msrb1Q9JLC3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msrb1Q9JLC3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msrb1Q9JLC3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msrb1Q9JLC3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msrb1Q9JLC3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msrb1Q9JLC3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msrb1Q9JLC3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msrb1Q9JLC3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msrb1Q9JLC3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Msrb1Q9JLC3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Msrb1Q9JLC3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Msrb1Q9JLC3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msrb1Q9JLC3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msrb1Q9JLC3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Msrb1Q9JLC3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msrb1Q9JLC3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msrb1Q9JLC3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msrb1Q9JLC3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msrb1Q9JLC3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msrb1Q9JLC3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msrb1Q9JLC3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msrb1Q9JLC3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msrb1Q9JLC3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msrb1Q9JLC3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msrb1Q9JLC3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msrb1Q9JLC3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msrb1Q9JLC3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msrb1Q9JLC3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msrb1Q9JLC3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msrb1Q9JLC3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msrb1Q9JLC3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msrb1Q9JLC3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms