Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK0

Rcan3, Calcipressin-3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcan3Q9JKK0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rcan3Q9JKK0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rcan3Q9JKK0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rcan3Q9JKK0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rcan3Q9JKK0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rcan3Q9JKK0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rcan3Q9JKK0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rcan3Q9JKK0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rcan3Q9JKK0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rcan3Q9JKK0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rcan3Q9JKK0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rcan3Q9JKK0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rcan3Q9JKK0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rcan3Q9JKK0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rcan3Q9JKK0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rcan3Q9JKK0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rcan3Q9JKK0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rcan3Q9JKK0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rcan3Q9JKK0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rcan3Q9JKK0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rcan3Q9JKK0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rcan3Q9JKK0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rcan3Q9JKK0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rcan3Q9JKK0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rcan3Q9JKK0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Rcan3Q9JKK0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rcan3Q9JKK0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rcan3Q9JKK0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rcan3Q9JKK0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rcan3Q9JKK0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rcan3Q9JKK0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rcan3Q9JKK0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rcan3Q9JKK0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rcan3Q9JKK0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rcan3Q9JKK0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rcan3Q9JKK0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rcan3Q9JKK0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rcan3Q9JKK0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rcan3Q9JKK0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rcan3Q9JKK0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rcan3Q9JKK0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rcan3Q9JKK0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rcan3Q9JKK0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rcan3Q9JKK0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rcan3Q9JKK0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rcan3Q9JKK0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rcan3Q9JKK0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rcan3Q9JKK0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rcan3Q9JKK0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rcan3Q9JKK0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Rcan3Q9JKK0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rcan3Q9JKK0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rcan3Q9JKK0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rcan3Q9JKK0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rcan3Q9JKK0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rcan3Q9JKK0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rcan3Q9JKK0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rcan3Q9JKK0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rcan3Q9JKK0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rcan3Q9JKK0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rcan3Q9JKK0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rcan3Q9JKK0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rcan3Q9JKK0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rcan3Q9JKK0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Rcan3Q9JKK0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rcan3Q9JKK0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rcan3Q9JKK0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rcan3Q9JKK0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rcan3Q9JKK0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Rcan3Q9JKK0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rcan3Q9JKK0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rcan3Q9JKK0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rcan3Q9JKK0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rcan3Q9JKK0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rcan3Q9JKK0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rcan3Q9JKK0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rcan3Q9JKK0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rcan3Q9JKK0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rcan3Q9JKK0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rcan3Q9JKK0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rcan3Q9JKK0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rcan3Q9JKK0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rcan3Q9JKK0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rcan3Q9JKK0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rcan3Q9JKK0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rcan3Q9JKK0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rcan3Q9JKK0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rcan3Q9JKK0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rcan3Q9JKK0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rcan3Q9JKK0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rcan3Q9JKK0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rcan3Q9JKK0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rcan3Q9JKK0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rcan3Q9JKK0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rcan3Q9JKK0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rcan3Q9JKK0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rcan3Q9JKK0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rcan3Q9JKK0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rcan3Q9JKK0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rcan3Q9JKK0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms