Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ap4m1Q9JKC7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ap4m1Q9JKC7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ap4m1Q9JKC7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ap4m1Q9JKC7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ap4m1Q9JKC7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ap4m1Q9JKC7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ap4m1Q9JKC7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ap4m1Q9JKC7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ap4m1Q9JKC7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ap4m1Q9JKC7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ap4m1Q9JKC7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ap4m1Q9JKC7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ap4m1Q9JKC7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ap4m1Q9JKC7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ap4m1Q9JKC7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ap4m1Q9JKC7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ap4m1Q9JKC7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ap4m1Q9JKC7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ap4m1Q9JKC7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap4m1Q9JKC7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap4m1Q9JKC7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap4m1Q9JKC7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ap4m1Q9JKC7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ap4m1Q9JKC7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ap4m1Q9JKC7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ap4m1Q9JKC7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ap4m1Q9JKC7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ap4m1Q9JKC7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ap4m1Q9JKC7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ap4m1Q9JKC7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ap4m1Q9JKC7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ap4m1Q9JKC7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ap4m1Q9JKC7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ap4m1Q9JKC7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ap4m1Q9JKC7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ap4m1Q9JKC7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ap4m1Q9JKC7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ap4m1Q9JKC7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ap4m1Q9JKC7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ap4m1Q9JKC7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ap4m1Q9JKC7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ap4m1Q9JKC7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ap4m1Q9JKC7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ap4m1Q9JKC7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ap4m1Q9JKC7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ap4m1Q9JKC7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ap4m1Q9JKC7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ap4m1Q9JKC7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ap4m1Q9JKC7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ap4m1Q9JKC7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ap4m1Q9JKC7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ap4m1Q9JKC7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ap4m1Q9JKC7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ap4m1Q9JKC7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ap4m1Q9JKC7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ap4m1Q9JKC7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ap4m1Q9JKC7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ap4m1Q9JKC7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ap4m1Q9JKC7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ap4m1Q9JKC7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ap4m1Q9JKC7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ap4m1Q9JKC7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ap4m1Q9JKC7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ap4m1Q9JKC7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ap4m1Q9JKC7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ap4m1Q9JKC7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ap4m1Q9JKC7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ap4m1Q9JKC7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ap4m1Q9JKC7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ap4m1Q9JKC7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ap4m1Q9JKC7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ap4m1Q9JKC7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ap4m1Q9JKC7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ap4m1Q9JKC7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ap4m1Q9JKC7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ap4m1Q9JKC7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ap4m1Q9JKC7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ap4m1Q9JKC7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ap4m1Q9JKC7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ap4m1Q9JKC7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ap4m1Q9JKC7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ap4m1Q9JKC7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ap4m1Q9JKC7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ap4m1Q9JKC7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ap4m1Q9JKC7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ap4m1Q9JKC7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ap4m1Q9JKC7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ap4m1Q9JKC7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ap4m1Q9JKC7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ap4m1Q9JKC7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ap4m1Q9JKC7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ap4m1Q9JKC7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ap4m1Q9JKC7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ap4m1Q9JKC7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ap4m1Q9JKC7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ap4m1Q9JKC7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ap4m1Q9JKC7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ap4m1Q9JKC7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ap4m1Q9JKC7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms