Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK97

Kcnq4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnq4Q9JK97 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kcnq4Q9JK97 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kcnq4Q9JK97 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kcnq4Q9JK97 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kcnq4Q9JK97 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kcnq4Q9JK97 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kcnq4Q9JK97 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kcnq4Q9JK97 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kcnq4Q9JK97 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kcnq4Q9JK97 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Kcnq4Q9JK97 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kcnq4Q9JK97 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kcnq4Q9JK97 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kcnq4Q9JK97 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kcnq4Q9JK97 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kcnq4Q9JK97 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kcnq4Q9JK97 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kcnq4Q9JK97 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kcnq4Q9JK97 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kcnq4Q9JK97 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kcnq4Q9JK97 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kcnq4Q9JK97 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kcnq4Q9JK97 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kcnq4Q9JK97 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kcnq4Q9JK97 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kcnq4Q9JK97 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kcnq4Q9JK97 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Kcnq4Q9JK97 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Kcnq4Q9JK97 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kcnq4Q9JK97 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kcnq4Q9JK97 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kcnq4Q9JK97 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kcnq4Q9JK97 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kcnq4Q9JK97 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kcnq4Q9JK97 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Kcnq4Q9JK97 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kcnq4Q9JK97 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kcnq4Q9JK97 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Kcnq4Q9JK97 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Kcnq4Q9JK97 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Kcnq4Q9JK97 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Kcnq4Q9JK97 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Kcnq4Q9JK97 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Kcnq4Q9JK97 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Kcnq4Q9JK97 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Kcnq4Q9JK97 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Kcnq4Q9JK97 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Kcnq4Q9JK97 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Kcnq4Q9JK97 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kcnq4Q9JK97 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kcnq4Q9JK97 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kcnq4Q9JK97 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kcnq4Q9JK97 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Kcnq4Q9JK97 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kcnq4Q9JK97 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kcnq4Q9JK97 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kcnq4Q9JK97 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kcnq4Q9JK97 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kcnq4Q9JK97 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kcnq4Q9JK97 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kcnq4Q9JK97 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kcnq4Q9JK97 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kcnq4Q9JK97 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kcnq4Q9JK97 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Kcnq4Q9JK97 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kcnq4Q9JK97 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kcnq4Q9JK97 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kcnq4Q9JK97 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kcnq4Q9JK97 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kcnq4Q9JK97 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kcnq4Q9JK97 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kcnq4Q9JK97 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kcnq4Q9JK97 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kcnq4Q9JK97 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kcnq4Q9JK97 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kcnq4Q9JK97 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kcnq4Q9JK97 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kcnq4Q9JK97 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kcnq4Q9JK97 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kcnq4Q9JK97 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kcnq4Q9JK97 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Kcnq4Q9JK97 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kcnq4Q9JK97 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kcnq4Q9JK97 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kcnq4Q9JK97 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kcnq4Q9JK97 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kcnq4Q9JK97 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kcnq4Q9JK97 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kcnq4Q9JK97 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Kcnq4Q9JK97 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kcnq4Q9JK97 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kcnq4Q9JK97 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kcnq4Q9JK97 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kcnq4Q9JK97 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kcnq4Q9JK97 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kcnq4Q9JK97 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kcnq4Q9JK97 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kcnq4Q9JK97 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kcnq4Q9JK97 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kcnq4Q9JK97 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms