Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pard6bQ9JK83 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pard6bQ9JK83 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pard6bQ9JK83 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pard6bQ9JK83 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pard6bQ9JK83 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pard6bQ9JK83 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pard6bQ9JK83 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pard6bQ9JK83 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pard6bQ9JK83 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pard6bQ9JK83 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pard6bQ9JK83 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pard6bQ9JK83 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pard6bQ9JK83 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pard6bQ9JK83 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pard6bQ9JK83 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pard6bQ9JK83 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pard6bQ9JK83 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pard6bQ9JK83 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pard6bQ9JK83 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pard6bQ9JK83 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pard6bQ9JK83 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pard6bQ9JK83 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pard6bQ9JK83 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pard6bQ9JK83 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pard6bQ9JK83 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pard6bQ9JK83 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Pard6bQ9JK83 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pard6bQ9JK83 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pard6bQ9JK83 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pard6bQ9JK83 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pard6bQ9JK83 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pard6bQ9JK83 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pard6bQ9JK83 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pard6bQ9JK83 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pard6bQ9JK83 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pard6bQ9JK83 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pard6bQ9JK83 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pard6bQ9JK83 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pard6bQ9JK83 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pard6bQ9JK83 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pard6bQ9JK83 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pard6bQ9JK83 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pard6bQ9JK83 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pard6bQ9JK83 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pard6bQ9JK83 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pard6bQ9JK83 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pard6bQ9JK83 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pard6bQ9JK83 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pard6bQ9JK83 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pard6bQ9JK83 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pard6bQ9JK83 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pard6bQ9JK83 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pard6bQ9JK83 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pard6bQ9JK83 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pard6bQ9JK83 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pard6bQ9JK83 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pard6bQ9JK83 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pard6bQ9JK83 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pard6bQ9JK83 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pard6bQ9JK83 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pard6bQ9JK83 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pard6bQ9JK83 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pard6bQ9JK83 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pard6bQ9JK83 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pard6bQ9JK83 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pard6bQ9JK83 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pard6bQ9JK83 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pard6bQ9JK83 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pard6bQ9JK83 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pard6bQ9JK83 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pard6bQ9JK83 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pard6bQ9JK83 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pard6bQ9JK83 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pard6bQ9JK83 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pard6bQ9JK83 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pard6bQ9JK83 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pard6bQ9JK83 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pard6bQ9JK83 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pard6bQ9JK83 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pard6bQ9JK83 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pard6bQ9JK83 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pard6bQ9JK83 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pard6bQ9JK83 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pard6bQ9JK83 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pard6bQ9JK83 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pard6bQ9JK83 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pard6bQ9JK83 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pard6bQ9JK83 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pard6bQ9JK83 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pard6bQ9JK83 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pard6bQ9JK83 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pard6bQ9JK83 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pard6bQ9JK83 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pard6bQ9JK83 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pard6bQ9JK83 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pard6bQ9JK83 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Pard6bQ9JK83 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pard6bQ9JK83 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pard6bQ9JK83 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms