Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHG6

Rcan1, Calcipressin-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcan1Q9JHG6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rcan1Q9JHG6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rcan1Q9JHG6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rcan1Q9JHG6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rcan1Q9JHG6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Rcan1Q9JHG6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rcan1Q9JHG6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rcan1Q9JHG6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rcan1Q9JHG6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rcan1Q9JHG6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rcan1Q9JHG6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rcan1Q9JHG6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Rcan1Q9JHG6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Rcan1Q9JHG6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rcan1Q9JHG6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rcan1Q9JHG6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Rcan1Q9JHG6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Rcan1Q9JHG6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rcan1Q9JHG6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rcan1Q9JHG6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rcan1Q9JHG6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rcan1Q9JHG6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rcan1Q9JHG6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rcan1Q9JHG6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rcan1Q9JHG6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rcan1Q9JHG6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Rcan1Q9JHG6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rcan1Q9JHG6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rcan1Q9JHG6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rcan1Q9JHG6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rcan1Q9JHG6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rcan1Q9JHG6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rcan1Q9JHG6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rcan1Q9JHG6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rcan1Q9JHG6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rcan1Q9JHG6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rcan1Q9JHG6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rcan1Q9JHG6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rcan1Q9JHG6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rcan1Q9JHG6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rcan1Q9JHG6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rcan1Q9JHG6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rcan1Q9JHG6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rcan1Q9JHG6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rcan1Q9JHG6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rcan1Q9JHG6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rcan1Q9JHG6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rcan1Q9JHG6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rcan1Q9JHG6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rcan1Q9JHG6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rcan1Q9JHG6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rcan1Q9JHG6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rcan1Q9JHG6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rcan1Q9JHG6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rcan1Q9JHG6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rcan1Q9JHG6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rcan1Q9JHG6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rcan1Q9JHG6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rcan1Q9JHG6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rcan1Q9JHG6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rcan1Q9JHG6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rcan1Q9JHG6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rcan1Q9JHG6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rcan1Q9JHG6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rcan1Q9JHG6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rcan1Q9JHG6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rcan1Q9JHG6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rcan1Q9JHG6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rcan1Q9JHG6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rcan1Q9JHG6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rcan1Q9JHG6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rcan1Q9JHG6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rcan1Q9JHG6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rcan1Q9JHG6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rcan1Q9JHG6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rcan1Q9JHG6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rcan1Q9JHG6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rcan1Q9JHG6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rcan1Q9JHG6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rcan1Q9JHG6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rcan1Q9JHG6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rcan1Q9JHG6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rcan1Q9JHG6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rcan1Q9JHG6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rcan1Q9JHG6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rcan1Q9JHG6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rcan1Q9JHG6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rcan1Q9JHG6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rcan1Q9JHG6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rcan1Q9JHG6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rcan1Q9JHG6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rcan1Q9JHG6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rcan1Q9JHG6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rcan1Q9JHG6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rcan1Q9JHG6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rcan1Q9JHG6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rcan1Q9JHG6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rcan1Q9JHG6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rcan1Q9JHG6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rcan1Q9JHG6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms