Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ48

V1ra8, Vomeronasal type-1 receptor A8, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1ra8Q9EQ48 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
V1ra8Q9EQ48 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
V1ra8Q9EQ48 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
V1ra8Q9EQ48 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
V1ra8Q9EQ48 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
V1ra8Q9EQ48 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
V1ra8Q9EQ48 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
V1ra8Q9EQ48 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
V1ra8Q9EQ48 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
V1ra8Q9EQ48 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
V1ra8Q9EQ48 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
V1ra8Q9EQ48 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
V1ra8Q9EQ48 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
V1ra8Q9EQ48 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
V1ra8Q9EQ48 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
V1ra8Q9EQ48 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
V1ra8Q9EQ48 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
V1ra8Q9EQ48 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
V1ra8Q9EQ48 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
V1ra8Q9EQ48 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
V1ra8Q9EQ48 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
V1ra8Q9EQ48 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
V1ra8Q9EQ48 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
V1ra8Q9EQ48 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
V1ra8Q9EQ48 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
V1ra8Q9EQ48 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
V1ra8Q9EQ48 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
V1ra8Q9EQ48 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
V1ra8Q9EQ48 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
V1ra8Q9EQ48 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
V1ra8Q9EQ48 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
V1ra8Q9EQ48 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
V1ra8Q9EQ48 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
V1ra8Q9EQ48 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
V1ra8Q9EQ48 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
V1ra8Q9EQ48 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
V1ra8Q9EQ48 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
V1ra8Q9EQ48 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
V1ra8Q9EQ48 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
V1ra8Q9EQ48 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
V1ra8Q9EQ48 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
V1ra8Q9EQ48 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
V1ra8Q9EQ48 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
V1ra8Q9EQ48 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
V1ra8Q9EQ48 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
V1ra8Q9EQ48 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
V1ra8Q9EQ48 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
V1ra8Q9EQ48 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
V1ra8Q9EQ48 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
V1ra8Q9EQ48 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
V1ra8Q9EQ48 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
V1ra8Q9EQ48 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
V1ra8Q9EQ48 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
V1ra8Q9EQ48 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
V1ra8Q9EQ48 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
V1ra8Q9EQ48 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
V1ra8Q9EQ48 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
V1ra8Q9EQ48 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
V1ra8Q9EQ48 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
V1ra8Q9EQ48 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
V1ra8Q9EQ48 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
V1ra8Q9EQ48 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
V1ra8Q9EQ48 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
V1ra8Q9EQ48 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
V1ra8Q9EQ48 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
V1ra8Q9EQ48 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
V1ra8Q9EQ48 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
V1ra8Q9EQ48 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
V1ra8Q9EQ48 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
V1ra8Q9EQ48 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
V1ra8Q9EQ48 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
V1ra8Q9EQ48 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
V1ra8Q9EQ48 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
V1ra8Q9EQ48 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
V1ra8Q9EQ48 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
V1ra8Q9EQ48 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
V1ra8Q9EQ48 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
V1ra8Q9EQ48 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
V1ra8Q9EQ48 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
V1ra8Q9EQ48 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
V1ra8Q9EQ48 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
V1ra8Q9EQ48 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
V1ra8Q9EQ48 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
V1ra8Q9EQ48 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
V1ra8Q9EQ48 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
V1ra8Q9EQ48 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
V1ra8Q9EQ48 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
V1ra8Q9EQ48 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
V1ra8Q9EQ48 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
V1ra8Q9EQ48 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
V1ra8Q9EQ48 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
V1ra8Q9EQ48 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
V1ra8Q9EQ48 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
V1ra8Q9EQ48 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
V1ra8Q9EQ48 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
V1ra8Q9EQ48 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
V1ra8Q9EQ48 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
V1ra8Q9EQ48 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
V1ra8Q9EQ48 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
V1ra8Q9EQ48 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms