Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Rpgrip1Q9EPQ2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Rpgrip1Q9EPQ2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Rpgrip1Q9EPQ2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Rpgrip1Q9EPQ2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Rpgrip1Q9EPQ2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Rpgrip1Q9EPQ2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Rpgrip1Q9EPQ2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms