Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ1

Ikbip, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IkbipQ9DBZ1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IkbipQ9DBZ1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IkbipQ9DBZ1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IkbipQ9DBZ1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IkbipQ9DBZ1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IkbipQ9DBZ1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IkbipQ9DBZ1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IkbipQ9DBZ1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IkbipQ9DBZ1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IkbipQ9DBZ1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IkbipQ9DBZ1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IkbipQ9DBZ1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IkbipQ9DBZ1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IkbipQ9DBZ1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IkbipQ9DBZ1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IkbipQ9DBZ1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IkbipQ9DBZ1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IkbipQ9DBZ1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IkbipQ9DBZ1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IkbipQ9DBZ1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IkbipQ9DBZ1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IkbipQ9DBZ1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IkbipQ9DBZ1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IkbipQ9DBZ1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IkbipQ9DBZ1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IkbipQ9DBZ1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IkbipQ9DBZ1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IkbipQ9DBZ1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IkbipQ9DBZ1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IkbipQ9DBZ1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IkbipQ9DBZ1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IkbipQ9DBZ1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IkbipQ9DBZ1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IkbipQ9DBZ1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IkbipQ9DBZ1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IkbipQ9DBZ1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IkbipQ9DBZ1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IkbipQ9DBZ1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IkbipQ9DBZ1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IkbipQ9DBZ1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IkbipQ9DBZ1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IkbipQ9DBZ1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IkbipQ9DBZ1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IkbipQ9DBZ1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IkbipQ9DBZ1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IkbipQ9DBZ1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IkbipQ9DBZ1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IkbipQ9DBZ1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IkbipQ9DBZ1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IkbipQ9DBZ1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IkbipQ9DBZ1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IkbipQ9DBZ1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IkbipQ9DBZ1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IkbipQ9DBZ1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IkbipQ9DBZ1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IkbipQ9DBZ1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IkbipQ9DBZ1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IkbipQ9DBZ1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IkbipQ9DBZ1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IkbipQ9DBZ1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IkbipQ9DBZ1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IkbipQ9DBZ1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IkbipQ9DBZ1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IkbipQ9DBZ1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IkbipQ9DBZ1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IkbipQ9DBZ1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IkbipQ9DBZ1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IkbipQ9DBZ1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IkbipQ9DBZ1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IkbipQ9DBZ1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
IkbipQ9DBZ1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IkbipQ9DBZ1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IkbipQ9DBZ1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IkbipQ9DBZ1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IkbipQ9DBZ1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IkbipQ9DBZ1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IkbipQ9DBZ1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IkbipQ9DBZ1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IkbipQ9DBZ1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IkbipQ9DBZ1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IkbipQ9DBZ1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IkbipQ9DBZ1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IkbipQ9DBZ1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IkbipQ9DBZ1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IkbipQ9DBZ1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IkbipQ9DBZ1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IkbipQ9DBZ1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IkbipQ9DBZ1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IkbipQ9DBZ1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IkbipQ9DBZ1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IkbipQ9DBZ1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IkbipQ9DBZ1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IkbipQ9DBZ1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IkbipQ9DBZ1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IkbipQ9DBZ1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IkbipQ9DBZ1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IkbipQ9DBZ1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IkbipQ9DBZ1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IkbipQ9DBZ1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IkbipQ9DBZ1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms