Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB75

Cdip1, Cell death-inducing p53-target protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdip1Q9DB75 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdip1Q9DB75 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdip1Q9DB75 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdip1Q9DB75 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdip1Q9DB75 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdip1Q9DB75 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdip1Q9DB75 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdip1Q9DB75 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdip1Q9DB75 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdip1Q9DB75 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdip1Q9DB75 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdip1Q9DB75 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdip1Q9DB75 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdip1Q9DB75 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdip1Q9DB75 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdip1Q9DB75 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdip1Q9DB75 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdip1Q9DB75 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdip1Q9DB75 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdip1Q9DB75 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdip1Q9DB75 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdip1Q9DB75 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdip1Q9DB75 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdip1Q9DB75 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cdip1Q9DB75 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdip1Q9DB75 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdip1Q9DB75 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdip1Q9DB75 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdip1Q9DB75 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdip1Q9DB75 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdip1Q9DB75 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdip1Q9DB75 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdip1Q9DB75 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdip1Q9DB75 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdip1Q9DB75 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdip1Q9DB75 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdip1Q9DB75 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdip1Q9DB75 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdip1Q9DB75 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdip1Q9DB75 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdip1Q9DB75 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdip1Q9DB75 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdip1Q9DB75 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdip1Q9DB75 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdip1Q9DB75 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdip1Q9DB75 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdip1Q9DB75 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdip1Q9DB75 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdip1Q9DB75 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdip1Q9DB75 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdip1Q9DB75 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdip1Q9DB75 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdip1Q9DB75 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdip1Q9DB75 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdip1Q9DB75 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdip1Q9DB75 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdip1Q9DB75 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdip1Q9DB75 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdip1Q9DB75 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdip1Q9DB75 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdip1Q9DB75 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdip1Q9DB75 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdip1Q9DB75 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdip1Q9DB75 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdip1Q9DB75 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdip1Q9DB75 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdip1Q9DB75 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdip1Q9DB75 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdip1Q9DB75 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdip1Q9DB75 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdip1Q9DB75 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdip1Q9DB75 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdip1Q9DB75 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdip1Q9DB75 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdip1Q9DB75 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdip1Q9DB75 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdip1Q9DB75 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdip1Q9DB75 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdip1Q9DB75 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdip1Q9DB75 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdip1Q9DB75 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdip1Q9DB75 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdip1Q9DB75 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdip1Q9DB75 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdip1Q9DB75 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdip1Q9DB75 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdip1Q9DB75 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdip1Q9DB75 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdip1Q9DB75 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdip1Q9DB75 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdip1Q9DB75 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdip1Q9DB75 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdip1Q9DB75 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdip1Q9DB75 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdip1Q9DB75 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdip1Q9DB75 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdip1Q9DB75 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdip1Q9DB75 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdip1Q9DB75 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdip1Q9DB75 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms