Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB24

Tceal6, Transcription elongation factor A (SII)-like 6, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tceal6Q9DB24 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tceal6Q9DB24 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tceal6Q9DB24 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tceal6Q9DB24 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tceal6Q9DB24 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tceal6Q9DB24 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tceal6Q9DB24 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tceal6Q9DB24 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tceal6Q9DB24 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tceal6Q9DB24 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tceal6Q9DB24 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tceal6Q9DB24 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tceal6Q9DB24 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tceal6Q9DB24 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tceal6Q9DB24 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tceal6Q9DB24 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tceal6Q9DB24 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tceal6Q9DB24 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tceal6Q9DB24 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tceal6Q9DB24 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tceal6Q9DB24 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tceal6Q9DB24 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tceal6Q9DB24 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tceal6Q9DB24 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tceal6Q9DB24 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tceal6Q9DB24 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tceal6Q9DB24 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tceal6Q9DB24 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tceal6Q9DB24 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tceal6Q9DB24 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tceal6Q9DB24 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tceal6Q9DB24 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tceal6Q9DB24 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tceal6Q9DB24 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tceal6Q9DB24 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tceal6Q9DB24 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tceal6Q9DB24 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tceal6Q9DB24 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tceal6Q9DB24 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tceal6Q9DB24 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tceal6Q9DB24 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tceal6Q9DB24 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tceal6Q9DB24 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tceal6Q9DB24 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tceal6Q9DB24 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tceal6Q9DB24 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tceal6Q9DB24 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tceal6Q9DB24 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tceal6Q9DB24 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tceal6Q9DB24 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tceal6Q9DB24 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tceal6Q9DB24 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tceal6Q9DB24 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tceal6Q9DB24 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tceal6Q9DB24 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tceal6Q9DB24 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tceal6Q9DB24 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tceal6Q9DB24 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tceal6Q9DB24 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tceal6Q9DB24 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tceal6Q9DB24 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tceal6Q9DB24 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tceal6Q9DB24 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tceal6Q9DB24 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tceal6Q9DB24 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tceal6Q9DB24 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tceal6Q9DB24 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tceal6Q9DB24 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tceal6Q9DB24 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tceal6Q9DB24 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tceal6Q9DB24 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tceal6Q9DB24 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tceal6Q9DB24 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tceal6Q9DB24 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tceal6Q9DB24 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tceal6Q9DB24 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tceal6Q9DB24 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tceal6Q9DB24 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tceal6Q9DB24 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tceal6Q9DB24 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tceal6Q9DB24 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tceal6Q9DB24 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tceal6Q9DB24 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tceal6Q9DB24 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tceal6Q9DB24 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tceal6Q9DB24 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tceal6Q9DB24 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tceal6Q9DB24 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tceal6Q9DB24 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tceal6Q9DB24 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tceal6Q9DB24 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tceal6Q9DB24 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tceal6Q9DB24 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tceal6Q9DB24 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tceal6Q9DB24 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tceal6Q9DB24 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tceal6Q9DB24 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tceal6Q9DB24 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tceal6Q9DB24 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tceal6Q9DB24 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms