Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Slc52a2Q9D8F3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Slc52a2Q9D8F3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Slc52a2Q9D8F3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Slc52a2Q9D8F3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Slc52a2Q9D8F3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Slc52a2Q9D8F3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Slc52a2Q9D8F3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Slc52a2Q9D8F3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Slc52a2Q9D8F3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Slc52a2Q9D8F3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Slc52a2Q9D8F3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Slc52a2Q9D8F3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Slc52a2Q9D8F3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Slc52a2Q9D8F3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Slc52a2Q9D8F3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Slc52a2Q9D8F3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Slc52a2Q9D8F3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Slc52a2Q9D8F3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Slc52a2Q9D8F3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Slc52a2Q9D8F3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Slc52a2Q9D8F3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Slc52a2Q9D8F3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Slc52a2Q9D8F3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Slc52a2Q9D8F3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Slc52a2Q9D8F3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Slc52a2Q9D8F3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Slc52a2Q9D8F3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Slc52a2Q9D8F3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Slc52a2Q9D8F3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Slc52a2Q9D8F3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Slc52a2Q9D8F3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Slc52a2Q9D8F3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Slc52a2Q9D8F3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Slc52a2Q9D8F3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Slc52a2Q9D8F3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Slc52a2Q9D8F3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Slc52a2Q9D8F3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Slc52a2Q9D8F3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Slc52a2Q9D8F3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Slc52a2Q9D8F3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Slc52a2Q9D8F3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Slc52a2Q9D8F3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Slc52a2Q9D8F3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Slc52a2Q9D8F3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Slc52a2Q9D8F3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Slc52a2Q9D8F3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Slc52a2Q9D8F3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Slc52a2Q9D8F3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Slc52a2Q9D8F3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Slc52a2Q9D8F3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Slc52a2Q9D8F3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Slc52a2Q9D8F3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Slc52a2Q9D8F3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Slc52a2Q9D8F3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Slc52a2Q9D8F3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Slc52a2Q9D8F3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Slc52a2Q9D8F3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Slc52a2Q9D8F3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Slc52a2Q9D8F3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Slc52a2Q9D8F3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Slc52a2Q9D8F3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Slc52a2Q9D8F3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Slc52a2Q9D8F3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Slc52a2Q9D8F3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Slc52a2Q9D8F3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Slc52a2Q9D8F3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Slc52a2Q9D8F3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Slc52a2Q9D8F3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Slc52a2Q9D8F3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Slc52a2Q9D8F3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Slc52a2Q9D8F3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Slc52a2Q9D8F3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Slc52a2Q9D8F3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Slc52a2Q9D8F3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Slc52a2Q9D8F3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Slc52a2Q9D8F3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Slc52a2Q9D8F3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Slc52a2Q9D8F3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Slc52a2Q9D8F3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Slc52a2Q9D8F3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Slc52a2Q9D8F3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Slc52a2Q9D8F3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Slc52a2Q9D8F3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Slc52a2Q9D8F3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Slc52a2Q9D8F3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Slc52a2Q9D8F3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Slc52a2Q9D8F3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Slc52a2Q9D8F3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Slc52a2Q9D8F3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Slc52a2Q9D8F3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Slc52a2Q9D8F3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Slc52a2Q9D8F3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Slc52a2Q9D8F3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Slc52a2Q9D8F3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Slc52a2Q9D8F3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Slc52a2Q9D8F3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Slc52a2Q9D8F3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Slc52a2Q9D8F3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms