Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J4

Necab3, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab3Q9D6J4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Necab3Q9D6J4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Necab3Q9D6J4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Necab3Q9D6J4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Necab3Q9D6J4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Necab3Q9D6J4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Necab3Q9D6J4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Necab3Q9D6J4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Necab3Q9D6J4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Necab3Q9D6J4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Necab3Q9D6J4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Necab3Q9D6J4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Necab3Q9D6J4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Necab3Q9D6J4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Necab3Q9D6J4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Necab3Q9D6J4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Necab3Q9D6J4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Necab3Q9D6J4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Necab3Q9D6J4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Necab3Q9D6J4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Necab3Q9D6J4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Necab3Q9D6J4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Necab3Q9D6J4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Necab3Q9D6J4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Necab3Q9D6J4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Necab3Q9D6J4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Necab3Q9D6J4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Necab3Q9D6J4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Necab3Q9D6J4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Necab3Q9D6J4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Necab3Q9D6J4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Necab3Q9D6J4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Necab3Q9D6J4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Necab3Q9D6J4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Necab3Q9D6J4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Necab3Q9D6J4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Necab3Q9D6J4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Necab3Q9D6J4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Necab3Q9D6J4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Necab3Q9D6J4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Necab3Q9D6J4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Necab3Q9D6J4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Necab3Q9D6J4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Necab3Q9D6J4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Necab3Q9D6J4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Necab3Q9D6J4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Necab3Q9D6J4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Necab3Q9D6J4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Necab3Q9D6J4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Necab3Q9D6J4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Necab3Q9D6J4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Necab3Q9D6J4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Necab3Q9D6J4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Necab3Q9D6J4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Necab3Q9D6J4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Necab3Q9D6J4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Necab3Q9D6J4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Necab3Q9D6J4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Necab3Q9D6J4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Necab3Q9D6J4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Necab3Q9D6J4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Necab3Q9D6J4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Necab3Q9D6J4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Necab3Q9D6J4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Necab3Q9D6J4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Necab3Q9D6J4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Necab3Q9D6J4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Necab3Q9D6J4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Necab3Q9D6J4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Necab3Q9D6J4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Necab3Q9D6J4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Necab3Q9D6J4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Necab3Q9D6J4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Necab3Q9D6J4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Necab3Q9D6J4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Necab3Q9D6J4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Necab3Q9D6J4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Necab3Q9D6J4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Necab3Q9D6J4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Necab3Q9D6J4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Necab3Q9D6J4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Necab3Q9D6J4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Necab3Q9D6J4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Necab3Q9D6J4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Necab3Q9D6J4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Necab3Q9D6J4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Necab3Q9D6J4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Necab3Q9D6J4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Necab3Q9D6J4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Necab3Q9D6J4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Necab3Q9D6J4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Necab3Q9D6J4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Necab3Q9D6J4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Necab3Q9D6J4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Necab3Q9D6J4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Necab3Q9D6J4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Necab3Q9D6J4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Necab3Q9D6J4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Necab3Q9D6J4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Necab3Q9D6J4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms