Protein–RNA interactions for Protein: Q9D687

Slc6a19, Sodium-dependent neutral amino acid transporter B(0)AT1, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a19Q9D687 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc6a19Q9D687 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc6a19Q9D687 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc6a19Q9D687 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc6a19Q9D687 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc6a19Q9D687 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc6a19Q9D687 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc6a19Q9D687 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc6a19Q9D687 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc6a19Q9D687 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc6a19Q9D687 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc6a19Q9D687 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc6a19Q9D687 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc6a19Q9D687 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc6a19Q9D687 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc6a19Q9D687 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc6a19Q9D687 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc6a19Q9D687 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc6a19Q9D687 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc6a19Q9D687 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc6a19Q9D687 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc6a19Q9D687 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc6a19Q9D687 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc6a19Q9D687 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc6a19Q9D687 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc6a19Q9D687 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc6a19Q9D687 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc6a19Q9D687 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc6a19Q9D687 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc6a19Q9D687 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc6a19Q9D687 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc6a19Q9D687 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc6a19Q9D687 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc6a19Q9D687 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc6a19Q9D687 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc6a19Q9D687 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc6a19Q9D687 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc6a19Q9D687 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc6a19Q9D687 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc6a19Q9D687 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc6a19Q9D687 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc6a19Q9D687 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc6a19Q9D687 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc6a19Q9D687 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc6a19Q9D687 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc6a19Q9D687 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc6a19Q9D687 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc6a19Q9D687 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc6a19Q9D687 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc6a19Q9D687 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc6a19Q9D687 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc6a19Q9D687 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc6a19Q9D687 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc6a19Q9D687 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc6a19Q9D687 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc6a19Q9D687 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc6a19Q9D687 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc6a19Q9D687 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc6a19Q9D687 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc6a19Q9D687 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc6a19Q9D687 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc6a19Q9D687 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc6a19Q9D687 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc6a19Q9D687 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc6a19Q9D687 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc6a19Q9D687 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc6a19Q9D687 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc6a19Q9D687 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc6a19Q9D687 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc6a19Q9D687 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc6a19Q9D687 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc6a19Q9D687 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc6a19Q9D687 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc6a19Q9D687 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc6a19Q9D687 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc6a19Q9D687 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc6a19Q9D687 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc6a19Q9D687 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc6a19Q9D687 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc6a19Q9D687 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc6a19Q9D687 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc6a19Q9D687 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc6a19Q9D687 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc6a19Q9D687 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc6a19Q9D687 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc6a19Q9D687 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc6a19Q9D687 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc6a19Q9D687 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc6a19Q9D687 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc6a19Q9D687 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc6a19Q9D687 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc6a19Q9D687 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc6a19Q9D687 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc6a19Q9D687 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc6a19Q9D687 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc6a19Q9D687 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc6a19Q9D687 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc6a19Q9D687 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc6a19Q9D687 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc6a19Q9D687 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms