Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3V5

Fsip1, Fibrous sheath-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fsip1Q9D3V5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fsip1Q9D3V5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fsip1Q9D3V5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fsip1Q9D3V5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fsip1Q9D3V5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fsip1Q9D3V5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fsip1Q9D3V5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fsip1Q9D3V5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fsip1Q9D3V5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Fsip1Q9D3V5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fsip1Q9D3V5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fsip1Q9D3V5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Fsip1Q9D3V5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fsip1Q9D3V5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fsip1Q9D3V5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fsip1Q9D3V5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fsip1Q9D3V5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fsip1Q9D3V5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fsip1Q9D3V5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fsip1Q9D3V5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fsip1Q9D3V5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fsip1Q9D3V5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fsip1Q9D3V5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fsip1Q9D3V5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fsip1Q9D3V5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fsip1Q9D3V5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fsip1Q9D3V5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fsip1Q9D3V5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fsip1Q9D3V5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fsip1Q9D3V5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fsip1Q9D3V5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fsip1Q9D3V5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fsip1Q9D3V5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fsip1Q9D3V5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fsip1Q9D3V5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fsip1Q9D3V5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fsip1Q9D3V5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fsip1Q9D3V5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fsip1Q9D3V5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Fsip1Q9D3V5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fsip1Q9D3V5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fsip1Q9D3V5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fsip1Q9D3V5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fsip1Q9D3V5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fsip1Q9D3V5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fsip1Q9D3V5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fsip1Q9D3V5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fsip1Q9D3V5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fsip1Q9D3V5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fsip1Q9D3V5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fsip1Q9D3V5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Fsip1Q9D3V5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fsip1Q9D3V5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fsip1Q9D3V5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fsip1Q9D3V5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fsip1Q9D3V5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fsip1Q9D3V5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fsip1Q9D3V5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fsip1Q9D3V5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fsip1Q9D3V5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fsip1Q9D3V5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fsip1Q9D3V5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fsip1Q9D3V5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fsip1Q9D3V5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Fsip1Q9D3V5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Fsip1Q9D3V5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fsip1Q9D3V5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fsip1Q9D3V5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fsip1Q9D3V5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fsip1Q9D3V5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fsip1Q9D3V5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fsip1Q9D3V5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fsip1Q9D3V5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fsip1Q9D3V5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fsip1Q9D3V5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Fsip1Q9D3V5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Fsip1Q9D3V5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fsip1Q9D3V5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fsip1Q9D3V5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fsip1Q9D3V5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fsip1Q9D3V5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fsip1Q9D3V5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Fsip1Q9D3V5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fsip1Q9D3V5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fsip1Q9D3V5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fsip1Q9D3V5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fsip1Q9D3V5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fsip1Q9D3V5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fsip1Q9D3V5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Fsip1Q9D3V5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fsip1Q9D3V5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fsip1Q9D3V5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fsip1Q9D3V5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fsip1Q9D3V5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fsip1Q9D3V5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fsip1Q9D3V5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fsip1Q9D3V5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fsip1Q9D3V5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fsip1Q9D3V5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Fsip1Q9D3V5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms