Protein–RNA interactions for Protein: Q9D131

UPF0686 protein C11orf1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D131 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D131 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D131 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D131 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D131 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9D131 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9D131 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9D131 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9D131 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9D131 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9D131 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Q9D131 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9D131 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9D131 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9D131 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9D131 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9D131 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D131 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D131 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D131 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D131 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D131 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D131 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D131 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D131 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D131 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D131 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D131 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D131 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D131 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D131 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D131 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D131 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D131 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9D131 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D131 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D131 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D131 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D131 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D131 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D131 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D131 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D131 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D131 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D131 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D131 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D131 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D131 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D131 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D131 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D131 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D131 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D131 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D131 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D131 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D131 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D131 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D131 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D131 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D131 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D131 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D131 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D131 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D131 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D131 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D131 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D131 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D131 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D131 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D131 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D131 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D131 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D131 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D131 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D131 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D131 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D131 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D131 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D131 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D131 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D131 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Q9D131 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Q9D131 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D131 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D131 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D131 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D131 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D131 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D131 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D131 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D131 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D131 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D131 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D131 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D131 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D131 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D131 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D131 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D131 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D131 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms