Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pbdc1Q9D0B6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pbdc1Q9D0B6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pbdc1Q9D0B6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pbdc1Q9D0B6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pbdc1Q9D0B6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pbdc1Q9D0B6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pbdc1Q9D0B6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pbdc1Q9D0B6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pbdc1Q9D0B6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pbdc1Q9D0B6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pbdc1Q9D0B6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pbdc1Q9D0B6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pbdc1Q9D0B6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pbdc1Q9D0B6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pbdc1Q9D0B6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pbdc1Q9D0B6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pbdc1Q9D0B6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pbdc1Q9D0B6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pbdc1Q9D0B6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pbdc1Q9D0B6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pbdc1Q9D0B6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pbdc1Q9D0B6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pbdc1Q9D0B6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pbdc1Q9D0B6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pbdc1Q9D0B6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pbdc1Q9D0B6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pbdc1Q9D0B6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pbdc1Q9D0B6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pbdc1Q9D0B6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pbdc1Q9D0B6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pbdc1Q9D0B6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pbdc1Q9D0B6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pbdc1Q9D0B6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pbdc1Q9D0B6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pbdc1Q9D0B6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pbdc1Q9D0B6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pbdc1Q9D0B6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pbdc1Q9D0B6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pbdc1Q9D0B6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pbdc1Q9D0B6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pbdc1Q9D0B6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pbdc1Q9D0B6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pbdc1Q9D0B6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pbdc1Q9D0B6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pbdc1Q9D0B6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pbdc1Q9D0B6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pbdc1Q9D0B6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pbdc1Q9D0B6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pbdc1Q9D0B6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pbdc1Q9D0B6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pbdc1Q9D0B6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pbdc1Q9D0B6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pbdc1Q9D0B6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pbdc1Q9D0B6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pbdc1Q9D0B6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pbdc1Q9D0B6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pbdc1Q9D0B6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pbdc1Q9D0B6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pbdc1Q9D0B6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pbdc1Q9D0B6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pbdc1Q9D0B6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pbdc1Q9D0B6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pbdc1Q9D0B6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pbdc1Q9D0B6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pbdc1Q9D0B6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pbdc1Q9D0B6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pbdc1Q9D0B6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pbdc1Q9D0B6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pbdc1Q9D0B6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pbdc1Q9D0B6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pbdc1Q9D0B6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pbdc1Q9D0B6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pbdc1Q9D0B6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pbdc1Q9D0B6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pbdc1Q9D0B6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pbdc1Q9D0B6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pbdc1Q9D0B6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pbdc1Q9D0B6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pbdc1Q9D0B6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pbdc1Q9D0B6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pbdc1Q9D0B6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pbdc1Q9D0B6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pbdc1Q9D0B6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pbdc1Q9D0B6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pbdc1Q9D0B6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pbdc1Q9D0B6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pbdc1Q9D0B6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pbdc1Q9D0B6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pbdc1Q9D0B6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pbdc1Q9D0B6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pbdc1Q9D0B6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pbdc1Q9D0B6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pbdc1Q9D0B6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pbdc1Q9D0B6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pbdc1Q9D0B6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pbdc1Q9D0B6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pbdc1Q9D0B6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pbdc1Q9D0B6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pbdc1Q9D0B6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms