Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW2

Mrps22, 28S ribosomal protein S22, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps22Q9CXW2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mrps22Q9CXW2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mrps22Q9CXW2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mrps22Q9CXW2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mrps22Q9CXW2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mrps22Q9CXW2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mrps22Q9CXW2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mrps22Q9CXW2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mrps22Q9CXW2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mrps22Q9CXW2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mrps22Q9CXW2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mrps22Q9CXW2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mrps22Q9CXW2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mrps22Q9CXW2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mrps22Q9CXW2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Mrps22Q9CXW2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mrps22Q9CXW2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mrps22Q9CXW2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mrps22Q9CXW2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mrps22Q9CXW2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mrps22Q9CXW2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mrps22Q9CXW2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mrps22Q9CXW2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mrps22Q9CXW2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mrps22Q9CXW2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mrps22Q9CXW2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mrps22Q9CXW2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mrps22Q9CXW2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mrps22Q9CXW2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mrps22Q9CXW2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Mrps22Q9CXW2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mrps22Q9CXW2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mrps22Q9CXW2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mrps22Q9CXW2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mrps22Q9CXW2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mrps22Q9CXW2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mrps22Q9CXW2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mrps22Q9CXW2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mrps22Q9CXW2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Mrps22Q9CXW2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mrps22Q9CXW2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mrps22Q9CXW2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mrps22Q9CXW2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mrps22Q9CXW2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mrps22Q9CXW2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mrps22Q9CXW2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mrps22Q9CXW2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mrps22Q9CXW2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mrps22Q9CXW2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mrps22Q9CXW2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mrps22Q9CXW2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mrps22Q9CXW2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mrps22Q9CXW2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mrps22Q9CXW2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mrps22Q9CXW2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mrps22Q9CXW2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mrps22Q9CXW2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mrps22Q9CXW2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Mrps22Q9CXW2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mrps22Q9CXW2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mrps22Q9CXW2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mrps22Q9CXW2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mrps22Q9CXW2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mrps22Q9CXW2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mrps22Q9CXW2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mrps22Q9CXW2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mrps22Q9CXW2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mrps22Q9CXW2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mrps22Q9CXW2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mrps22Q9CXW2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mrps22Q9CXW2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mrps22Q9CXW2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mrps22Q9CXW2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mrps22Q9CXW2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mrps22Q9CXW2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mrps22Q9CXW2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mrps22Q9CXW2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mrps22Q9CXW2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mrps22Q9CXW2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mrps22Q9CXW2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mrps22Q9CXW2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mrps22Q9CXW2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mrps22Q9CXW2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mrps22Q9CXW2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mrps22Q9CXW2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mrps22Q9CXW2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mrps22Q9CXW2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mrps22Q9CXW2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Mrps22Q9CXW2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mrps22Q9CXW2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mrps22Q9CXW2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mrps22Q9CXW2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mrps22Q9CXW2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mrps22Q9CXW2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mrps22Q9CXW2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mrps22Q9CXW2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mrps22Q9CXW2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mrps22Q9CXW2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mrps22Q9CXW2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mrps22Q9CXW2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms