Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Yif1bQ9CX30 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Yif1bQ9CX30 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Yif1bQ9CX30 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Yif1bQ9CX30 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Yif1bQ9CX30 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Yif1bQ9CX30 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Yif1bQ9CX30 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Yif1bQ9CX30 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Yif1bQ9CX30 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Yif1bQ9CX30 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Yif1bQ9CX30 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Yif1bQ9CX30 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Yif1bQ9CX30 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Yif1bQ9CX30 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Yif1bQ9CX30 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Yif1bQ9CX30 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Yif1bQ9CX30 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Yif1bQ9CX30 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Yif1bQ9CX30 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Yif1bQ9CX30 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Yif1bQ9CX30 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Yif1bQ9CX30 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Yif1bQ9CX30 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Yif1bQ9CX30 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Yif1bQ9CX30 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Yif1bQ9CX30 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Yif1bQ9CX30 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Yif1bQ9CX30 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Yif1bQ9CX30 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Yif1bQ9CX30 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Yif1bQ9CX30 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Yif1bQ9CX30 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Yif1bQ9CX30 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Yif1bQ9CX30 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Yif1bQ9CX30 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Yif1bQ9CX30 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Yif1bQ9CX30 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Yif1bQ9CX30 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Yif1bQ9CX30 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Yif1bQ9CX30 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Yif1bQ9CX30 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Yif1bQ9CX30 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Yif1bQ9CX30 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Yif1bQ9CX30 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Yif1bQ9CX30 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Yif1bQ9CX30 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Yif1bQ9CX30 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Yif1bQ9CX30 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Yif1bQ9CX30 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Yif1bQ9CX30 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Yif1bQ9CX30 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Yif1bQ9CX30 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Yif1bQ9CX30 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Yif1bQ9CX30 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Yif1bQ9CX30 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Yif1bQ9CX30 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Yif1bQ9CX30 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Yif1bQ9CX30 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Yif1bQ9CX30 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Yif1bQ9CX30 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Yif1bQ9CX30 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Yif1bQ9CX30 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Yif1bQ9CX30 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Yif1bQ9CX30 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Yif1bQ9CX30 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Yif1bQ9CX30 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Yif1bQ9CX30 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Yif1bQ9CX30 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Yif1bQ9CX30 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Yif1bQ9CX30 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Yif1bQ9CX30 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Yif1bQ9CX30 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Yif1bQ9CX30 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Yif1bQ9CX30 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Yif1bQ9CX30 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Yif1bQ9CX30 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Yif1bQ9CX30 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Yif1bQ9CX30 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Yif1bQ9CX30 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Yif1bQ9CX30 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Yif1bQ9CX30 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Yif1bQ9CX30 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Yif1bQ9CX30 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Yif1bQ9CX30 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Yif1bQ9CX30 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Yif1bQ9CX30 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Yif1bQ9CX30 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Yif1bQ9CX30 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Yif1bQ9CX30 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Yif1bQ9CX30 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Yif1bQ9CX30 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Yif1bQ9CX30 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Yif1bQ9CX30 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Yif1bQ9CX30 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Yif1bQ9CX30 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Yif1bQ9CX30 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Yif1bQ9CX30 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Yif1bQ9CX30 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Yif1bQ9CX30 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms