Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ5

Prr13, Proline-rich protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr13Q9CQJ5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prr13Q9CQJ5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prr13Q9CQJ5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prr13Q9CQJ5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prr13Q9CQJ5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prr13Q9CQJ5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prr13Q9CQJ5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prr13Q9CQJ5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prr13Q9CQJ5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prr13Q9CQJ5 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prr13Q9CQJ5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prr13Q9CQJ5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Prr13Q9CQJ5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Prr13Q9CQJ5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prr13Q9CQJ5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prr13Q9CQJ5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prr13Q9CQJ5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prr13Q9CQJ5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prr13Q9CQJ5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prr13Q9CQJ5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prr13Q9CQJ5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prr13Q9CQJ5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prr13Q9CQJ5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prr13Q9CQJ5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prr13Q9CQJ5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prr13Q9CQJ5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prr13Q9CQJ5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prr13Q9CQJ5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prr13Q9CQJ5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prr13Q9CQJ5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prr13Q9CQJ5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prr13Q9CQJ5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prr13Q9CQJ5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prr13Q9CQJ5 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prr13Q9CQJ5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prr13Q9CQJ5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prr13Q9CQJ5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr13Q9CQJ5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr13Q9CQJ5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr13Q9CQJ5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr13Q9CQJ5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr13Q9CQJ5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr13Q9CQJ5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prr13Q9CQJ5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr13Q9CQJ5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr13Q9CQJ5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr13Q9CQJ5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr13Q9CQJ5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr13Q9CQJ5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prr13Q9CQJ5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr13Q9CQJ5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr13Q9CQJ5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr13Q9CQJ5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr13Q9CQJ5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prr13Q9CQJ5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prr13Q9CQJ5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prr13Q9CQJ5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prr13Q9CQJ5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prr13Q9CQJ5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prr13Q9CQJ5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prr13Q9CQJ5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prr13Q9CQJ5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prr13Q9CQJ5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prr13Q9CQJ5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prr13Q9CQJ5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr13Q9CQJ5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr13Q9CQJ5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr13Q9CQJ5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr13Q9CQJ5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr13Q9CQJ5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr13Q9CQJ5 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr13Q9CQJ5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr13Q9CQJ5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr13Q9CQJ5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr13Q9CQJ5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr13Q9CQJ5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr13Q9CQJ5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr13Q9CQJ5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr13Q9CQJ5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr13Q9CQJ5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr13Q9CQJ5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr13Q9CQJ5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr13Q9CQJ5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr13Q9CQJ5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr13Q9CQJ5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr13Q9CQJ5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr13Q9CQJ5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr13Q9CQJ5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr13Q9CQJ5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr13Q9CQJ5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prr13Q9CQJ5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prr13Q9CQJ5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr13Q9CQJ5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr13Q9CQJ5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr13Q9CQJ5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr13Q9CQJ5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr13Q9CQJ5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr13Q9CQJ5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr13Q9CQJ5 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr13Q9CQJ5 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms