Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Sar1bQ9CQC9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sar1bQ9CQC9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sar1bQ9CQC9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Sar1bQ9CQC9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sar1bQ9CQC9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sar1bQ9CQC9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sar1bQ9CQC9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sar1bQ9CQC9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sar1bQ9CQC9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sar1bQ9CQC9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sar1bQ9CQC9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sar1bQ9CQC9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sar1bQ9CQC9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sar1bQ9CQC9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sar1bQ9CQC9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sar1bQ9CQC9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sar1bQ9CQC9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sar1bQ9CQC9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sar1bQ9CQC9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sar1bQ9CQC9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sar1bQ9CQC9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sar1bQ9CQC9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sar1bQ9CQC9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sar1bQ9CQC9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sar1bQ9CQC9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sar1bQ9CQC9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sar1bQ9CQC9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sar1bQ9CQC9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sar1bQ9CQC9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sar1bQ9CQC9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sar1bQ9CQC9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sar1bQ9CQC9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sar1bQ9CQC9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sar1bQ9CQC9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sar1bQ9CQC9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sar1bQ9CQC9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Sar1bQ9CQC9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sar1bQ9CQC9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sar1bQ9CQC9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sar1bQ9CQC9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sar1bQ9CQC9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sar1bQ9CQC9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sar1bQ9CQC9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sar1bQ9CQC9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sar1bQ9CQC9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sar1bQ9CQC9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sar1bQ9CQC9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sar1bQ9CQC9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sar1bQ9CQC9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sar1bQ9CQC9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sar1bQ9CQC9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sar1bQ9CQC9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sar1bQ9CQC9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sar1bQ9CQC9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sar1bQ9CQC9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sar1bQ9CQC9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sar1bQ9CQC9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sar1bQ9CQC9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sar1bQ9CQC9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sar1bQ9CQC9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sar1bQ9CQC9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sar1bQ9CQC9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sar1bQ9CQC9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sar1bQ9CQC9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sar1bQ9CQC9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sar1bQ9CQC9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sar1bQ9CQC9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sar1bQ9CQC9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sar1bQ9CQC9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sar1bQ9CQC9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sar1bQ9CQC9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sar1bQ9CQC9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sar1bQ9CQC9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sar1bQ9CQC9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sar1bQ9CQC9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sar1bQ9CQC9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sar1bQ9CQC9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sar1bQ9CQC9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sar1bQ9CQC9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sar1bQ9CQC9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sar1bQ9CQC9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sar1bQ9CQC9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sar1bQ9CQC9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sar1bQ9CQC9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Sar1bQ9CQC9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sar1bQ9CQC9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sar1bQ9CQC9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sar1bQ9CQC9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sar1bQ9CQC9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sar1bQ9CQC9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sar1bQ9CQC9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sar1bQ9CQC9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sar1bQ9CQC9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sar1bQ9CQC9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sar1bQ9CQC9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sar1bQ9CQC9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sar1bQ9CQC9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sar1bQ9CQC9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sar1bQ9CQC9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms