Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPQ3

Tomm22, Mitochondrial import receptor subunit TOM22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm22Q9CPQ3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tomm22Q9CPQ3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tomm22Q9CPQ3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tomm22Q9CPQ3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Tomm22Q9CPQ3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tomm22Q9CPQ3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tomm22Q9CPQ3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tomm22Q9CPQ3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tomm22Q9CPQ3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tomm22Q9CPQ3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tomm22Q9CPQ3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tomm22Q9CPQ3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tomm22Q9CPQ3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Tomm22Q9CPQ3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tomm22Q9CPQ3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tomm22Q9CPQ3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tomm22Q9CPQ3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tomm22Q9CPQ3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tomm22Q9CPQ3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Tomm22Q9CPQ3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Tomm22Q9CPQ3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tomm22Q9CPQ3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tomm22Q9CPQ3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tomm22Q9CPQ3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tomm22Q9CPQ3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tomm22Q9CPQ3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tomm22Q9CPQ3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tomm22Q9CPQ3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tomm22Q9CPQ3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tomm22Q9CPQ3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tomm22Q9CPQ3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tomm22Q9CPQ3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tomm22Q9CPQ3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tomm22Q9CPQ3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tomm22Q9CPQ3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tomm22Q9CPQ3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tomm22Q9CPQ3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tomm22Q9CPQ3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tomm22Q9CPQ3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tomm22Q9CPQ3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tomm22Q9CPQ3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tomm22Q9CPQ3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tomm22Q9CPQ3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tomm22Q9CPQ3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tomm22Q9CPQ3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tomm22Q9CPQ3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tomm22Q9CPQ3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tomm22Q9CPQ3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tomm22Q9CPQ3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tomm22Q9CPQ3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tomm22Q9CPQ3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tomm22Q9CPQ3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tomm22Q9CPQ3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tomm22Q9CPQ3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tomm22Q9CPQ3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tomm22Q9CPQ3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tomm22Q9CPQ3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tomm22Q9CPQ3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tomm22Q9CPQ3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tomm22Q9CPQ3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tomm22Q9CPQ3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tomm22Q9CPQ3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tomm22Q9CPQ3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Tomm22Q9CPQ3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tomm22Q9CPQ3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tomm22Q9CPQ3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tomm22Q9CPQ3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tomm22Q9CPQ3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tomm22Q9CPQ3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tomm22Q9CPQ3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tomm22Q9CPQ3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tomm22Q9CPQ3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tomm22Q9CPQ3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tomm22Q9CPQ3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tomm22Q9CPQ3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tomm22Q9CPQ3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tomm22Q9CPQ3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tomm22Q9CPQ3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tomm22Q9CPQ3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Tomm22Q9CPQ3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tomm22Q9CPQ3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tomm22Q9CPQ3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Tomm22Q9CPQ3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tomm22Q9CPQ3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tomm22Q9CPQ3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tomm22Q9CPQ3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tomm22Q9CPQ3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tomm22Q9CPQ3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tomm22Q9CPQ3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tomm22Q9CPQ3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tomm22Q9CPQ3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tomm22Q9CPQ3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tomm22Q9CPQ3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Tomm22Q9CPQ3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Tomm22Q9CPQ3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tomm22Q9CPQ3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tomm22Q9CPQ3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tomm22Q9CPQ3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tomm22Q9CPQ3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tomm22Q9CPQ3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms