Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B1

FTO, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FTOQ9C0B1 SCNN1D-207ENST00000467651 204 ntTSL 512.58□□□□□ -0.45e-7■■■■■ 33.1
FTOQ9C0B1 ARHGAP5-204ENST00000432921 5003 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.51e-10■■■■■ 33.1
FTOQ9C0B1 ARHGAP5-208ENST00000555814 583 ntTSL 410.45□□□□□ -0.741e-8■■■■■ 33.1
FTOQ9C0B1 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.381e-8■■■■■ 33.1
FTOQ9C0B1 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.421e-8■■■■■ 33.1
FTOQ9C0B1 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.831e-10■■■■■ 33.1
FTOQ9C0B1 MAT1A-201ENST00000372213 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.833e-6■■■■■ 33
FTOQ9C0B1 KDM4B-210ENST00000592175 562 ntTSL 418.6■□□□□ 0.573e-6■■■■■ 32.7
FTOQ9C0B1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.53e-8■■■■■ 32.6
FTOQ9C0B1 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-202ENST00000584900 1636 ntTSL 220.25■□□□□ 0.834e-7■■■■■ 32.5
FTOQ9C0B1 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-201ENST00000579700 1222 ntTSL 218.29■□□□□ 0.524e-7■■■■■ 32.5
FTOQ9C0B1 DTX2P1-201ENST00000425797 1633 ntBASIC15.45■□□□□ 0.064e-7■■■■■ 32.5
FTOQ9C0B1 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.074e-7■■■■■ 32.5
FTOQ9C0B1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.81e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.845e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.276e-7■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 RHOT2-225ENST00000570092 674 ntTSL 328.25■■■□□ 2.115e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 RHOT2-204ENST00000561983 1044 ntTSL 528.13■■■□□ 2.095e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 RHOT2-209ENST00000563134 736 ntTSL 227.32■■□□□ 1.965e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.95e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 RHOT2-207ENST00000562708 672 ntTSL 526.87■■□□□ 1.895e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 RHOT2-214ENST00000566214 683 ntTSL 526.87■■□□□ 1.895e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.835e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 RHOT2-216ENST00000567017 1094 ntTSL 526.43■■□□□ 1.825e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 ANXA5-206ENST00000511552 1036 ntTSL 326.04■■□□□ 1.765e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 RHOT2-219ENST00000568950 1343 ntTSL 525.67■■□□□ 1.75e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.645e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 PROC-204ENST00000419985 500 ntTSL 425.23■■□□□ 1.635e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.515e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 RHOT2-226ENST00000570280 708 ntTSL 324.22■■□□□ 1.475e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 CAPN15-205ENST00000567216 3174 ntTSL 1 (best)23.5■■□□□ 1.355e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 LRP8-209ENST00000480045 3231 ntTSL 523.43■■□□□ 1.345e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.275e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 RHOT2-210ENST00000563637 993 ntTSL 522.9■■□□□ 1.265e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 PROC-208ENST00000442644 600 ntTSL 322.65■■□□□ 1.225e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 RHOT2-205ENST00000562333 1052 ntTSL 522.58■■□□□ 1.215e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.25e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.144e-11■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.125e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.116e-7■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 RHOT2-222ENST00000569675 2559 ntTSL 221.39■■□□□ 1.015e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 RHOT2-211ENST00000563776 923 ntTSL 321.12■□□□□ 0.975e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 EIF4G1-237ENST00000485712 474 ntTSL 421.01■□□□□ 0.951e-8■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.874e-7■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.875e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 RHOT2-215ENST00000566965 879 ntTSL 519.92■□□□□ 0.785e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 RHOT2-218ENST00000568636 3098 ntTSL 219.71■□□□□ 0.755e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 SLC22A31-205ENST00000603735 791 ntTSL 319.47■□□□□ 0.715e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 RHOT2-206ENST00000562598 612 ntTSL 319.42■□□□□ 0.75e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.55e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.465e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 RHOT2-227ENST00000602564 3695 ntTSL 517.74■□□□□ 0.435e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 RHOT2-224ENST00000569943 635 ntTSL 317.65■□□□□ 0.425e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 SLC22A31-204ENST00000568161 651 ntTSL 316.59■□□□□ 0.255e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.185e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.175e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.155e-6■■■■■ 32.2
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FTOQ9C0B1 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.125e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.095e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 RHOT2-203ENST00000561929 625 ntTSL 215.41■□□□□ 0.065e-6■■■■■ 32.2
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FTOQ9C0B1 ANXA5-207ENST00000513428 868 ntTSL 215.1■□□□□ 0.015e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 ANXA5-208ENST00000513523 582 ntTSL 315.01□□□□□ -0.015e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 C3-209ENST00000597442 469 ntTSL 314.34□□□□□ -0.115e-6■■■■■ 32.2
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FTOQ9C0B1 EIF4G1-214ENST00000427141 730 ntTSL 513.63□□□□□ -0.231e-8■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 EIF4G1-220ENST00000440448 578 ntTSL 412.62□□□□□ -0.391e-8■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 EIF4G1-223ENST00000444134 558 ntTSL 512.35□□□□□ -0.431e-8■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 BOK-202ENST00000641230 183 nt11.26□□□□□ -0.615e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 DYNC1H1-203ENST00000554854 721 ntTSL 39.85□□□□□ -0.835e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 ANXA5-204ENST00000509016 556 ntTSL 49.83□□□□□ -0.845e-6■■■■■ 32.2
FTOQ9C0B1 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.131e-8■■■■■ 32.1
FTOQ9C0B1 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.413e-7■■■■■ 31.9
FTOQ9C0B1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.677e-7■■■■■ 31.8
FTOQ9C0B1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.67e-7■■■■■ 31.8
FTOQ9C0B1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.67e-7■■■■■ 31.8
FTOQ9C0B1 FTCD-212ENST00000498355 1936 ntTSL 230.94■■■□□ 2.547e-7■■■■■ 31.8
FTOQ9C0B1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.347e-7■■■■■ 31.8
FTOQ9C0B1 SSRP1-202ENST00000293880 6296 ntTSL 217.58■□□□□ 0.47e-8■■■■■ 31.6
FTOQ9C0B1 SSRP1-201ENST00000278412 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.217e-8■■■■■ 31.6
FTOQ9C0B1 YY1-203ENST00000554371 636 ntTSL 328.02■■■□□ 2.083e-7■■■■■ 31.4
FTOQ9C0B1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.673e-7■■■■■ 31.4
FTOQ9C0B1 BLCAP-207ENST00000414080 581 ntTSL 325.3■■□□□ 1.643e-7■■■■■ 31.4
FTOQ9C0B1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.383e-7■■■■■ 31.4
FTOQ9C0B1 BLCAP-212ENST00000456058 572 ntTSL 423.28■■□□□ 1.323e-7■■■■■ 31.4
FTOQ9C0B1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.133e-7■■■■■ 31.4
FTOQ9C0B1 BLCAP-210ENST00000445723 588 ntTSL 421.06■□□□□ 0.963e-7■■■■■ 31.4
FTOQ9C0B1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.843e-7■■■■■ 31.4
FTOQ9C0B1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.823e-7■■■■■ 31.4
FTOQ9C0B1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.683e-7■■■■■ 31.4
FTOQ9C0B1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.553e-7■■■■■ 31.4
FTOQ9C0B1 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.543e-7■■■■■ 31.4
FTOQ9C0B1 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.543e-7■■■■■ 31.4
FTOQ9C0B1 BLCAP-213ENST00000467603 439 ntTSL 318.14■□□□□ 0.493e-7■■■■■ 31.4
FTOQ9C0B1 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.393e-7■■■■■ 31.4
FTOQ9C0B1 PDHX-207ENST00000533262 561 ntTSL 417.49■□□□□ 0.393e-7■■■■■ 31.4
FTOQ9C0B1 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.363e-7■■■■■ 31.4
FTOQ9C0B1 BLCAP-209ENST00000432507 591 ntTSL 417.32■□□□□ 0.363e-7■■■■■ 31.4
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