Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SrrtQ99MR6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SrrtQ99MR6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SrrtQ99MR6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SrrtQ99MR6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SrrtQ99MR6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SrrtQ99MR6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SrrtQ99MR6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SrrtQ99MR6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SrrtQ99MR6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SrrtQ99MR6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SrrtQ99MR6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SrrtQ99MR6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SrrtQ99MR6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SrrtQ99MR6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SrrtQ99MR6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SrrtQ99MR6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SrrtQ99MR6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SrrtQ99MR6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SrrtQ99MR6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SrrtQ99MR6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SrrtQ99MR6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SrrtQ99MR6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SrrtQ99MR6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SrrtQ99MR6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SrrtQ99MR6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SrrtQ99MR6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SrrtQ99MR6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SrrtQ99MR6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SrrtQ99MR6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SrrtQ99MR6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SrrtQ99MR6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SrrtQ99MR6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SrrtQ99MR6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SrrtQ99MR6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SrrtQ99MR6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SrrtQ99MR6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SrrtQ99MR6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SrrtQ99MR6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SrrtQ99MR6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SrrtQ99MR6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SrrtQ99MR6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SrrtQ99MR6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SrrtQ99MR6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SrrtQ99MR6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SrrtQ99MR6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SrrtQ99MR6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SrrtQ99MR6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SrrtQ99MR6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SrrtQ99MR6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SrrtQ99MR6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SrrtQ99MR6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SrrtQ99MR6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SrrtQ99MR6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SrrtQ99MR6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SrrtQ99MR6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SrrtQ99MR6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SrrtQ99MR6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SrrtQ99MR6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SrrtQ99MR6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SrrtQ99MR6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SrrtQ99MR6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SrrtQ99MR6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SrrtQ99MR6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SrrtQ99MR6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SrrtQ99MR6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SrrtQ99MR6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SrrtQ99MR6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SrrtQ99MR6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SrrtQ99MR6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SrrtQ99MR6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SrrtQ99MR6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SrrtQ99MR6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SrrtQ99MR6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SrrtQ99MR6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SrrtQ99MR6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SrrtQ99MR6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SrrtQ99MR6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SrrtQ99MR6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SrrtQ99MR6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SrrtQ99MR6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SrrtQ99MR6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SrrtQ99MR6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SrrtQ99MR6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SrrtQ99MR6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SrrtQ99MR6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SrrtQ99MR6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SrrtQ99MR6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SrrtQ99MR6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SrrtQ99MR6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SrrtQ99MR6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SrrtQ99MR6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SrrtQ99MR6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SrrtQ99MR6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SrrtQ99MR6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SrrtQ99MR6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SrrtQ99MR6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SrrtQ99MR6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SrrtQ99MR6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SrrtQ99MR6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms