Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Nlgn1Q99K10 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Nlgn1Q99K10 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Nlgn1Q99K10 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Nlgn1Q99K10 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Nlgn1Q99K10 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Nlgn1Q99K10 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Nlgn1Q99K10 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Nlgn1Q99K10 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Nlgn1Q99K10 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Nlgn1Q99K10 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Nlgn1Q99K10 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Nlgn1Q99K10 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Nlgn1Q99K10 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Nlgn1Q99K10 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Nlgn1Q99K10 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Nlgn1Q99K10 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Nlgn1Q99K10 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Nlgn1Q99K10 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Nlgn1Q99K10 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Nlgn1Q99K10 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Nlgn1Q99K10 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Nlgn1Q99K10 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Nlgn1Q99K10 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Nlgn1Q99K10 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Nlgn1Q99K10 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Nlgn1Q99K10 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Nlgn1Q99K10 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Nlgn1Q99K10 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Nlgn1Q99K10 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Nlgn1Q99K10 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Nlgn1Q99K10 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Nlgn1Q99K10 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Nlgn1Q99K10 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Nlgn1Q99K10 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Nlgn1Q99K10 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Nlgn1Q99K10 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Nlgn1Q99K10 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Nlgn1Q99K10 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Nlgn1Q99K10 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Nlgn1Q99K10 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Nlgn1Q99K10 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Nlgn1Q99K10 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Nlgn1Q99K10 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Nlgn1Q99K10 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Nlgn1Q99K10 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Nlgn1Q99K10 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Nlgn1Q99K10 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Nlgn1Q99K10 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Nlgn1Q99K10 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Nlgn1Q99K10 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Nlgn1Q99K10 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Nlgn1Q99K10 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Nlgn1Q99K10 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Nlgn1Q99K10 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Nlgn1Q99K10 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Nlgn1Q99K10 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Nlgn1Q99K10 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Nlgn1Q99K10 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Nlgn1Q99K10 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Nlgn1Q99K10 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Nlgn1Q99K10 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Nlgn1Q99K10 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Nlgn1Q99K10 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Nlgn1Q99K10 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Nlgn1Q99K10 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Nlgn1Q99K10 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Nlgn1Q99K10 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Nlgn1Q99K10 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Nlgn1Q99K10 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Nlgn1Q99K10 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Nlgn1Q99K10 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Nlgn1Q99K10 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Nlgn1Q99K10 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Nlgn1Q99K10 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Nlgn1Q99K10 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Nlgn1Q99K10 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Nlgn1Q99K10 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Nlgn1Q99K10 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Nlgn1Q99K10 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Nlgn1Q99K10 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Nlgn1Q99K10 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Nlgn1Q99K10 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Nlgn1Q99K10 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Nlgn1Q99K10 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Nlgn1Q99K10 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Nlgn1Q99K10 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Nlgn1Q99K10 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Nlgn1Q99K10 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Nlgn1Q99K10 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Nlgn1Q99K10 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Nlgn1Q99K10 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Nlgn1Q99K10 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Nlgn1Q99K10 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Nlgn1Q99K10 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Nlgn1Q99K10 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Nlgn1Q99K10 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
Nlgn1Q99K10 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Nlgn1Q99K10 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Nlgn1Q99K10 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms