Protein–RNA interactions for Protein: Q922D8

Mthfd1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mthfd1Q922D8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mthfd1Q922D8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mthfd1Q922D8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mthfd1Q922D8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mthfd1Q922D8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mthfd1Q922D8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mthfd1Q922D8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Mthfd1Q922D8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mthfd1Q922D8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Mthfd1Q922D8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mthfd1Q922D8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mthfd1Q922D8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mthfd1Q922D8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mthfd1Q922D8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mthfd1Q922D8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mthfd1Q922D8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mthfd1Q922D8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mthfd1Q922D8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mthfd1Q922D8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mthfd1Q922D8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mthfd1Q922D8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mthfd1Q922D8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mthfd1Q922D8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mthfd1Q922D8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mthfd1Q922D8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Mthfd1Q922D8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mthfd1Q922D8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mthfd1Q922D8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mthfd1Q922D8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mthfd1Q922D8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mthfd1Q922D8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Mthfd1Q922D8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mthfd1Q922D8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mthfd1Q922D8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mthfd1Q922D8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mthfd1Q922D8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mthfd1Q922D8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mthfd1Q922D8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mthfd1Q922D8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mthfd1Q922D8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mthfd1Q922D8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mthfd1Q922D8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mthfd1Q922D8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mthfd1Q922D8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mthfd1Q922D8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mthfd1Q922D8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mthfd1Q922D8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mthfd1Q922D8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mthfd1Q922D8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mthfd1Q922D8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mthfd1Q922D8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mthfd1Q922D8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mthfd1Q922D8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mthfd1Q922D8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mthfd1Q922D8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mthfd1Q922D8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mthfd1Q922D8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mthfd1Q922D8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Mthfd1Q922D8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Mthfd1Q922D8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Mthfd1Q922D8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mthfd1Q922D8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mthfd1Q922D8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mthfd1Q922D8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mthfd1Q922D8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mthfd1Q922D8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mthfd1Q922D8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mthfd1Q922D8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mthfd1Q922D8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mthfd1Q922D8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mthfd1Q922D8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Mthfd1Q922D8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mthfd1Q922D8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mthfd1Q922D8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mthfd1Q922D8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mthfd1Q922D8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mthfd1Q922D8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mthfd1Q922D8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mthfd1Q922D8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mthfd1Q922D8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mthfd1Q922D8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mthfd1Q922D8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mthfd1Q922D8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mthfd1Q922D8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mthfd1Q922D8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mthfd1Q922D8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mthfd1Q922D8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mthfd1Q922D8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mthfd1Q922D8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mthfd1Q922D8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mthfd1Q922D8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mthfd1Q922D8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mthfd1Q922D8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mthfd1Q922D8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mthfd1Q922D8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mthfd1Q922D8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Mthfd1Q922D8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mthfd1Q922D8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mthfd1Q922D8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Mthfd1Q922D8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms