Protein–RNA interactions for Protein: Q920A0

Optc, Opticin, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptcQ920A0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OptcQ920A0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OptcQ920A0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OptcQ920A0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OptcQ920A0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OptcQ920A0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OptcQ920A0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OptcQ920A0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OptcQ920A0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OptcQ920A0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OptcQ920A0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OptcQ920A0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
OptcQ920A0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
OptcQ920A0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OptcQ920A0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OptcQ920A0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OptcQ920A0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OptcQ920A0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OptcQ920A0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OptcQ920A0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OptcQ920A0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OptcQ920A0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OptcQ920A0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OptcQ920A0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OptcQ920A0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OptcQ920A0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OptcQ920A0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OptcQ920A0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OptcQ920A0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OptcQ920A0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
OptcQ920A0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OptcQ920A0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OptcQ920A0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OptcQ920A0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OptcQ920A0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OptcQ920A0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OptcQ920A0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OptcQ920A0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OptcQ920A0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OptcQ920A0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OptcQ920A0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OptcQ920A0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OptcQ920A0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OptcQ920A0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OptcQ920A0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OptcQ920A0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OptcQ920A0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OptcQ920A0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OptcQ920A0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OptcQ920A0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OptcQ920A0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OptcQ920A0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OptcQ920A0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
OptcQ920A0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OptcQ920A0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OptcQ920A0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
OptcQ920A0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OptcQ920A0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OptcQ920A0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OptcQ920A0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OptcQ920A0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OptcQ920A0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OptcQ920A0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OptcQ920A0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OptcQ920A0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OptcQ920A0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OptcQ920A0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OptcQ920A0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OptcQ920A0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OptcQ920A0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OptcQ920A0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
OptcQ920A0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OptcQ920A0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OptcQ920A0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OptcQ920A0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OptcQ920A0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OptcQ920A0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OptcQ920A0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OptcQ920A0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OptcQ920A0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OptcQ920A0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
OptcQ920A0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OptcQ920A0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OptcQ920A0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OptcQ920A0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OptcQ920A0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
OptcQ920A0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OptcQ920A0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OptcQ920A0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OptcQ920A0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
OptcQ920A0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OptcQ920A0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OptcQ920A0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OptcQ920A0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OptcQ920A0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
OptcQ920A0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OptcQ920A0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OptcQ920A0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OptcQ920A0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OptcQ920A0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms