Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx11Q91WL6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx11Q91WL6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx11Q91WL6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx11Q91WL6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx11Q91WL6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx11Q91WL6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx11Q91WL6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx11Q91WL6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx11Q91WL6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx11Q91WL6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx11Q91WL6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx11Q91WL6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx11Q91WL6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx11Q91WL6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx11Q91WL6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx11Q91WL6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx11Q91WL6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx11Q91WL6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx11Q91WL6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx11Q91WL6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx11Q91WL6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx11Q91WL6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx11Q91WL6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx11Q91WL6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx11Q91WL6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx11Q91WL6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Snx11Q91WL6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx11Q91WL6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx11Q91WL6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx11Q91WL6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx11Q91WL6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx11Q91WL6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx11Q91WL6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx11Q91WL6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx11Q91WL6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx11Q91WL6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx11Q91WL6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx11Q91WL6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx11Q91WL6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx11Q91WL6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx11Q91WL6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx11Q91WL6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx11Q91WL6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snx11Q91WL6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx11Q91WL6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx11Q91WL6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx11Q91WL6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx11Q91WL6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx11Q91WL6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx11Q91WL6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx11Q91WL6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx11Q91WL6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx11Q91WL6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx11Q91WL6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx11Q91WL6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx11Q91WL6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx11Q91WL6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Snx11Q91WL6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx11Q91WL6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx11Q91WL6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx11Q91WL6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx11Q91WL6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx11Q91WL6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx11Q91WL6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx11Q91WL6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx11Q91WL6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx11Q91WL6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx11Q91WL6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx11Q91WL6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx11Q91WL6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Snx11Q91WL6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx11Q91WL6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx11Q91WL6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx11Q91WL6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx11Q91WL6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx11Q91WL6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx11Q91WL6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx11Q91WL6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx11Q91WL6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx11Q91WL6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx11Q91WL6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx11Q91WL6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx11Q91WL6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx11Q91WL6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx11Q91WL6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx11Q91WL6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx11Q91WL6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx11Q91WL6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx11Q91WL6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx11Q91WL6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx11Q91WL6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx11Q91WL6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx11Q91WL6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx11Q91WL6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx11Q91WL6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx11Q91WL6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx11Q91WL6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx11Q91WL6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx11Q91WL6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms