Protein–RNA interactions for Protein: Q91VU0

Fam3c, Protein FAM3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3cQ91VU0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam3cQ91VU0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam3cQ91VU0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam3cQ91VU0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam3cQ91VU0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam3cQ91VU0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam3cQ91VU0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam3cQ91VU0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fam3cQ91VU0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam3cQ91VU0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam3cQ91VU0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam3cQ91VU0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam3cQ91VU0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam3cQ91VU0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam3cQ91VU0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam3cQ91VU0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam3cQ91VU0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam3cQ91VU0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam3cQ91VU0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam3cQ91VU0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam3cQ91VU0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam3cQ91VU0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam3cQ91VU0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam3cQ91VU0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam3cQ91VU0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam3cQ91VU0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam3cQ91VU0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam3cQ91VU0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam3cQ91VU0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam3cQ91VU0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam3cQ91VU0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam3cQ91VU0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam3cQ91VU0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam3cQ91VU0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam3cQ91VU0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam3cQ91VU0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam3cQ91VU0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam3cQ91VU0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam3cQ91VU0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam3cQ91VU0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam3cQ91VU0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam3cQ91VU0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam3cQ91VU0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam3cQ91VU0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam3cQ91VU0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam3cQ91VU0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam3cQ91VU0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam3cQ91VU0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam3cQ91VU0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam3cQ91VU0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam3cQ91VU0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam3cQ91VU0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam3cQ91VU0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam3cQ91VU0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam3cQ91VU0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam3cQ91VU0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam3cQ91VU0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam3cQ91VU0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam3cQ91VU0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam3cQ91VU0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam3cQ91VU0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam3cQ91VU0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam3cQ91VU0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam3cQ91VU0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam3cQ91VU0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam3cQ91VU0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam3cQ91VU0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam3cQ91VU0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam3cQ91VU0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam3cQ91VU0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam3cQ91VU0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam3cQ91VU0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam3cQ91VU0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam3cQ91VU0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam3cQ91VU0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam3cQ91VU0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam3cQ91VU0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam3cQ91VU0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam3cQ91VU0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam3cQ91VU0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam3cQ91VU0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam3cQ91VU0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam3cQ91VU0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam3cQ91VU0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam3cQ91VU0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam3cQ91VU0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam3cQ91VU0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam3cQ91VU0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam3cQ91VU0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam3cQ91VU0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam3cQ91VU0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam3cQ91VU0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam3cQ91VU0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam3cQ91VU0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam3cQ91VU0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam3cQ91VU0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam3cQ91VU0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam3cQ91VU0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam3cQ91VU0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam3cQ91VU0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms