Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Dnaaf4Q8R368 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Dnaaf4Q8R368 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Dnaaf4Q8R368 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Dnaaf4Q8R368 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Dnaaf4Q8R368 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Dnaaf4Q8R368 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Dnaaf4Q8R368 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Dnaaf4Q8R368 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Dnaaf4Q8R368 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Dnaaf4Q8R368 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Dnaaf4Q8R368 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Dnaaf4Q8R368 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Dnaaf4Q8R368 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Dnaaf4Q8R368 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Dnaaf4Q8R368 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Dnaaf4Q8R368 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Dnaaf4Q8R368 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Dnaaf4Q8R368 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Dnaaf4Q8R368 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Dnaaf4Q8R368 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Dnaaf4Q8R368 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Dnaaf4Q8R368 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Dnaaf4Q8R368 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Dnaaf4Q8R368 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Dnaaf4Q8R368 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Dnaaf4Q8R368 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Dnaaf4Q8R368 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Dnaaf4Q8R368 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Dnaaf4Q8R368 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Dnaaf4Q8R368 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Dnaaf4Q8R368 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Dnaaf4Q8R368 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Dnaaf4Q8R368 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Dnaaf4Q8R368 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Dnaaf4Q8R368 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Dnaaf4Q8R368 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Dnaaf4Q8R368 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Dnaaf4Q8R368 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Dnaaf4Q8R368 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Dnaaf4Q8R368 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Dnaaf4Q8R368 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Dnaaf4Q8R368 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Dnaaf4Q8R368 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Dnaaf4Q8R368 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Dnaaf4Q8R368 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Dnaaf4Q8R368 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Dnaaf4Q8R368 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Dnaaf4Q8R368 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Dnaaf4Q8R368 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Dnaaf4Q8R368 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Dnaaf4Q8R368 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Dnaaf4Q8R368 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Dnaaf4Q8R368 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Dnaaf4Q8R368 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Dnaaf4Q8R368 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Dnaaf4Q8R368 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Dnaaf4Q8R368 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Dnaaf4Q8R368 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Dnaaf4Q8R368 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Dnaaf4Q8R368 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Dnaaf4Q8R368 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Dnaaf4Q8R368 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Dnaaf4Q8R368 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Dnaaf4Q8R368 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Dnaaf4Q8R368 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Dnaaf4Q8R368 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Dnaaf4Q8R368 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Dnaaf4Q8R368 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Dnaaf4Q8R368 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Dnaaf4Q8R368 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Dnaaf4Q8R368 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Dnaaf4Q8R368 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Dnaaf4Q8R368 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Dnaaf4Q8R368 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Dnaaf4Q8R368 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Dnaaf4Q8R368 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Dnaaf4Q8R368 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Dnaaf4Q8R368 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Dnaaf4Q8R368 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Dnaaf4Q8R368 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Dnaaf4Q8R368 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Dnaaf4Q8R368 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dnaaf4Q8R368 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dnaaf4Q8R368 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Dnaaf4Q8R368 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Dnaaf4Q8R368 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dnaaf4Q8R368 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dnaaf4Q8R368 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Dnaaf4Q8R368 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Dnaaf4Q8R368 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Dnaaf4Q8R368 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Dnaaf4Q8R368 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Dnaaf4Q8R368 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Dnaaf4Q8R368 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dnaaf4Q8R368 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dnaaf4Q8R368 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dnaaf4Q8R368 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dnaaf4Q8R368 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dnaaf4Q8R368 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms