Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZW7

Gabrp, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabrpQ8QZW7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GabrpQ8QZW7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GabrpQ8QZW7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GabrpQ8QZW7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GabrpQ8QZW7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GabrpQ8QZW7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GabrpQ8QZW7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GabrpQ8QZW7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GabrpQ8QZW7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GabrpQ8QZW7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GabrpQ8QZW7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GabrpQ8QZW7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GabrpQ8QZW7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GabrpQ8QZW7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GabrpQ8QZW7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GabrpQ8QZW7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GabrpQ8QZW7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GabrpQ8QZW7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GabrpQ8QZW7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GabrpQ8QZW7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GabrpQ8QZW7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GabrpQ8QZW7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GabrpQ8QZW7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GabrpQ8QZW7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GabrpQ8QZW7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GabrpQ8QZW7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GabrpQ8QZW7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GabrpQ8QZW7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GabrpQ8QZW7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GabrpQ8QZW7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GabrpQ8QZW7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GabrpQ8QZW7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GabrpQ8QZW7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GabrpQ8QZW7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GabrpQ8QZW7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GabrpQ8QZW7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GabrpQ8QZW7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GabrpQ8QZW7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GabrpQ8QZW7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GabrpQ8QZW7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GabrpQ8QZW7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GabrpQ8QZW7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GabrpQ8QZW7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GabrpQ8QZW7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GabrpQ8QZW7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GabrpQ8QZW7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GabrpQ8QZW7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GabrpQ8QZW7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GabrpQ8QZW7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GabrpQ8QZW7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GabrpQ8QZW7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GabrpQ8QZW7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GabrpQ8QZW7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GabrpQ8QZW7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GabrpQ8QZW7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GabrpQ8QZW7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GabrpQ8QZW7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GabrpQ8QZW7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GabrpQ8QZW7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GabrpQ8QZW7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GabrpQ8QZW7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GabrpQ8QZW7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GabrpQ8QZW7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GabrpQ8QZW7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GabrpQ8QZW7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GabrpQ8QZW7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GabrpQ8QZW7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GabrpQ8QZW7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GabrpQ8QZW7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GabrpQ8QZW7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GabrpQ8QZW7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GabrpQ8QZW7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GabrpQ8QZW7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GabrpQ8QZW7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GabrpQ8QZW7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GabrpQ8QZW7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GabrpQ8QZW7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GabrpQ8QZW7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GabrpQ8QZW7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GabrpQ8QZW7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GabrpQ8QZW7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GabrpQ8QZW7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GabrpQ8QZW7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GabrpQ8QZW7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GabrpQ8QZW7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GabrpQ8QZW7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GabrpQ8QZW7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GabrpQ8QZW7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GabrpQ8QZW7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GabrpQ8QZW7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GabrpQ8QZW7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GabrpQ8QZW7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GabrpQ8QZW7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GabrpQ8QZW7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GabrpQ8QZW7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GabrpQ8QZW7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GabrpQ8QZW7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GabrpQ8QZW7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GabrpQ8QZW7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GabrpQ8QZW7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms