Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc12Q8K5B8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxc12Q8K5B8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc12Q8K5B8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc12Q8K5B8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc12Q8K5B8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc12Q8K5B8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc12Q8K5B8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc12Q8K5B8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc12Q8K5B8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc12Q8K5B8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxc12Q8K5B8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxc12Q8K5B8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxc12Q8K5B8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxc12Q8K5B8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxc12Q8K5B8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxc12Q8K5B8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxc12Q8K5B8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxc12Q8K5B8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc12Q8K5B8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc12Q8K5B8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc12Q8K5B8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc12Q8K5B8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc12Q8K5B8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxc12Q8K5B8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxc12Q8K5B8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxc12Q8K5B8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc12Q8K5B8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc12Q8K5B8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc12Q8K5B8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc12Q8K5B8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc12Q8K5B8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc12Q8K5B8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc12Q8K5B8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hoxc12Q8K5B8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hoxc12Q8K5B8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc12Q8K5B8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc12Q8K5B8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc12Q8K5B8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc12Q8K5B8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc12Q8K5B8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc12Q8K5B8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc12Q8K5B8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc12Q8K5B8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc12Q8K5B8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc12Q8K5B8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc12Q8K5B8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc12Q8K5B8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc12Q8K5B8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc12Q8K5B8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc12Q8K5B8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc12Q8K5B8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc12Q8K5B8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc12Q8K5B8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc12Q8K5B8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc12Q8K5B8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc12Q8K5B8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc12Q8K5B8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc12Q8K5B8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc12Q8K5B8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc12Q8K5B8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc12Q8K5B8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc12Q8K5B8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc12Q8K5B8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc12Q8K5B8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc12Q8K5B8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc12Q8K5B8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc12Q8K5B8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc12Q8K5B8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc12Q8K5B8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc12Q8K5B8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc12Q8K5B8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxc12Q8K5B8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc12Q8K5B8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc12Q8K5B8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc12Q8K5B8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc12Q8K5B8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc12Q8K5B8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc12Q8K5B8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc12Q8K5B8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc12Q8K5B8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc12Q8K5B8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc12Q8K5B8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc12Q8K5B8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc12Q8K5B8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc12Q8K5B8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc12Q8K5B8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc12Q8K5B8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc12Q8K5B8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc12Q8K5B8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms