Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Q3

Foxn4, Forkhead box protein N4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn4Q8K3Q3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxn4Q8K3Q3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxn4Q8K3Q3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxn4Q8K3Q3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxn4Q8K3Q3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxn4Q8K3Q3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxn4Q8K3Q3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxn4Q8K3Q3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxn4Q8K3Q3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxn4Q8K3Q3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxn4Q8K3Q3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxn4Q8K3Q3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Foxn4Q8K3Q3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Foxn4Q8K3Q3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Foxn4Q8K3Q3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Foxn4Q8K3Q3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Foxn4Q8K3Q3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Foxn4Q8K3Q3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Foxn4Q8K3Q3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Foxn4Q8K3Q3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Foxn4Q8K3Q3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Foxn4Q8K3Q3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxn4Q8K3Q3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxn4Q8K3Q3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxn4Q8K3Q3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Foxn4Q8K3Q3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Foxn4Q8K3Q3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Foxn4Q8K3Q3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Foxn4Q8K3Q3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Foxn4Q8K3Q3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Foxn4Q8K3Q3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Foxn4Q8K3Q3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxn4Q8K3Q3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Foxn4Q8K3Q3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Foxn4Q8K3Q3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxn4Q8K3Q3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Foxn4Q8K3Q3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxn4Q8K3Q3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxn4Q8K3Q3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxn4Q8K3Q3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Foxn4Q8K3Q3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxn4Q8K3Q3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxn4Q8K3Q3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxn4Q8K3Q3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxn4Q8K3Q3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxn4Q8K3Q3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Foxn4Q8K3Q3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Foxn4Q8K3Q3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxn4Q8K3Q3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxn4Q8K3Q3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Foxn4Q8K3Q3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxn4Q8K3Q3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxn4Q8K3Q3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxn4Q8K3Q3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Foxn4Q8K3Q3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Foxn4Q8K3Q3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Foxn4Q8K3Q3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxn4Q8K3Q3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxn4Q8K3Q3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxn4Q8K3Q3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxn4Q8K3Q3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Foxn4Q8K3Q3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxn4Q8K3Q3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxn4Q8K3Q3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxn4Q8K3Q3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxn4Q8K3Q3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Foxn4Q8K3Q3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxn4Q8K3Q3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Foxn4Q8K3Q3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Foxn4Q8K3Q3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Foxn4Q8K3Q3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Foxn4Q8K3Q3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Foxn4Q8K3Q3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxn4Q8K3Q3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxn4Q8K3Q3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxn4Q8K3Q3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxn4Q8K3Q3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxn4Q8K3Q3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxn4Q8K3Q3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxn4Q8K3Q3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxn4Q8K3Q3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxn4Q8K3Q3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxn4Q8K3Q3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxn4Q8K3Q3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxn4Q8K3Q3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxn4Q8K3Q3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxn4Q8K3Q3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxn4Q8K3Q3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxn4Q8K3Q3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxn4Q8K3Q3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Foxn4Q8K3Q3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Foxn4Q8K3Q3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Foxn4Q8K3Q3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Foxn4Q8K3Q3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Foxn4Q8K3Q3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Foxn4Q8K3Q3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Foxn4Q8K3Q3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Foxn4Q8K3Q3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Foxn4Q8K3Q3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Foxn4Q8K3Q3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms