Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcf3Q8K268 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcf3Q8K268 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcf3Q8K268 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcf3Q8K268 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcf3Q8K268 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcf3Q8K268 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcf3Q8K268 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcf3Q8K268 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcf3Q8K268 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcf3Q8K268 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcf3Q8K268 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcf3Q8K268 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcf3Q8K268 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcf3Q8K268 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Abcf3Q8K268 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Abcf3Q8K268 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcf3Q8K268 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcf3Q8K268 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcf3Q8K268 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcf3Q8K268 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcf3Q8K268 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcf3Q8K268 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcf3Q8K268 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcf3Q8K268 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcf3Q8K268 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcf3Q8K268 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcf3Q8K268 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcf3Q8K268 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcf3Q8K268 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcf3Q8K268 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcf3Q8K268 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcf3Q8K268 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcf3Q8K268 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcf3Q8K268 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Abcf3Q8K268 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcf3Q8K268 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcf3Q8K268 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcf3Q8K268 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcf3Q8K268 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcf3Q8K268 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcf3Q8K268 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcf3Q8K268 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcf3Q8K268 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcf3Q8K268 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcf3Q8K268 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcf3Q8K268 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcf3Q8K268 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcf3Q8K268 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcf3Q8K268 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcf3Q8K268 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcf3Q8K268 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcf3Q8K268 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcf3Q8K268 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcf3Q8K268 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abcf3Q8K268 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abcf3Q8K268 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abcf3Q8K268 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcf3Q8K268 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcf3Q8K268 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcf3Q8K268 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcf3Q8K268 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcf3Q8K268 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcf3Q8K268 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcf3Q8K268 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcf3Q8K268 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcf3Q8K268 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcf3Q8K268 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcf3Q8K268 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcf3Q8K268 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcf3Q8K268 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcf3Q8K268 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcf3Q8K268 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcf3Q8K268 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcf3Q8K268 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcf3Q8K268 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcf3Q8K268 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcf3Q8K268 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcf3Q8K268 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Abcf3Q8K268 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Abcf3Q8K268 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Abcf3Q8K268 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcf3Q8K268 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcf3Q8K268 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcf3Q8K268 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcf3Q8K268 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcf3Q8K268 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcf3Q8K268 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcf3Q8K268 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcf3Q8K268 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcf3Q8K268 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcf3Q8K268 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcf3Q8K268 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcf3Q8K268 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcf3Q8K268 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcf3Q8K268 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcf3Q8K268 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Abcf3Q8K268 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Abcf3Q8K268 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Abcf3Q8K268 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.7 ms