Protein–RNA interactions for Protein: Q8K221

Arfip2, Arfaptin-2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip2Q8K221 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Arfip2Q8K221 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Arfip2Q8K221 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Arfip2Q8K221 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Arfip2Q8K221 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Arfip2Q8K221 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Arfip2Q8K221 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Arfip2Q8K221 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Arfip2Q8K221 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Arfip2Q8K221 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Arfip2Q8K221 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Arfip2Q8K221 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Arfip2Q8K221 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Arfip2Q8K221 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Arfip2Q8K221 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Arfip2Q8K221 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Arfip2Q8K221 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Arfip2Q8K221 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Arfip2Q8K221 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arfip2Q8K221 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Arfip2Q8K221 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Arfip2Q8K221 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Arfip2Q8K221 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Arfip2Q8K221 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Arfip2Q8K221 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Arfip2Q8K221 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Arfip2Q8K221 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Arfip2Q8K221 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Arfip2Q8K221 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arfip2Q8K221 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arfip2Q8K221 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arfip2Q8K221 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Arfip2Q8K221 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Arfip2Q8K221 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Arfip2Q8K221 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Arfip2Q8K221 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arfip2Q8K221 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arfip2Q8K221 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arfip2Q8K221 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arfip2Q8K221 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arfip2Q8K221 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arfip2Q8K221 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arfip2Q8K221 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arfip2Q8K221 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arfip2Q8K221 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arfip2Q8K221 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Arfip2Q8K221 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arfip2Q8K221 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arfip2Q8K221 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arfip2Q8K221 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Arfip2Q8K221 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Arfip2Q8K221 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Arfip2Q8K221 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Arfip2Q8K221 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arfip2Q8K221 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arfip2Q8K221 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arfip2Q8K221 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arfip2Q8K221 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arfip2Q8K221 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arfip2Q8K221 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Arfip2Q8K221 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Arfip2Q8K221 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arfip2Q8K221 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Arfip2Q8K221 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Arfip2Q8K221 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Arfip2Q8K221 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Arfip2Q8K221 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Arfip2Q8K221 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Arfip2Q8K221 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Arfip2Q8K221 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Arfip2Q8K221 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Arfip2Q8K221 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Arfip2Q8K221 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Arfip2Q8K221 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Arfip2Q8K221 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Arfip2Q8K221 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Arfip2Q8K221 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Arfip2Q8K221 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arfip2Q8K221 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arfip2Q8K221 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Arfip2Q8K221 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Arfip2Q8K221 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arfip2Q8K221 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arfip2Q8K221 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arfip2Q8K221 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arfip2Q8K221 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arfip2Q8K221 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Arfip2Q8K221 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Arfip2Q8K221 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Arfip2Q8K221 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Arfip2Q8K221 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Arfip2Q8K221 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Arfip2Q8K221 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Arfip2Q8K221 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Arfip2Q8K221 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Arfip2Q8K221 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Arfip2Q8K221 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Arfip2Q8K221 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Arfip2Q8K221 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arfip2Q8K221 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms