Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E0

Stx5, Syntaxin-5, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx5Q8K1E0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stx5Q8K1E0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stx5Q8K1E0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx5Q8K1E0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx5Q8K1E0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx5Q8K1E0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx5Q8K1E0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx5Q8K1E0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx5Q8K1E0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx5Q8K1E0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stx5Q8K1E0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stx5Q8K1E0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stx5Q8K1E0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx5Q8K1E0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx5Q8K1E0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx5Q8K1E0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx5Q8K1E0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx5Q8K1E0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stx5Q8K1E0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stx5Q8K1E0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stx5Q8K1E0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stx5Q8K1E0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stx5Q8K1E0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stx5Q8K1E0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stx5Q8K1E0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stx5Q8K1E0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx5Q8K1E0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx5Q8K1E0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx5Q8K1E0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx5Q8K1E0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx5Q8K1E0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx5Q8K1E0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx5Q8K1E0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Stx5Q8K1E0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Stx5Q8K1E0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stx5Q8K1E0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stx5Q8K1E0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stx5Q8K1E0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx5Q8K1E0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stx5Q8K1E0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stx5Q8K1E0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx5Q8K1E0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx5Q8K1E0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx5Q8K1E0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx5Q8K1E0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx5Q8K1E0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx5Q8K1E0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx5Q8K1E0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx5Q8K1E0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx5Q8K1E0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx5Q8K1E0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx5Q8K1E0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx5Q8K1E0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx5Q8K1E0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx5Q8K1E0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx5Q8K1E0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stx5Q8K1E0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx5Q8K1E0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx5Q8K1E0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx5Q8K1E0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx5Q8K1E0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx5Q8K1E0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx5Q8K1E0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx5Q8K1E0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stx5Q8K1E0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stx5Q8K1E0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stx5Q8K1E0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stx5Q8K1E0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stx5Q8K1E0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stx5Q8K1E0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx5Q8K1E0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx5Q8K1E0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx5Q8K1E0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx5Q8K1E0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx5Q8K1E0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx5Q8K1E0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx5Q8K1E0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx5Q8K1E0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx5Q8K1E0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx5Q8K1E0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx5Q8K1E0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx5Q8K1E0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx5Q8K1E0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx5Q8K1E0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx5Q8K1E0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx5Q8K1E0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx5Q8K1E0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx5Q8K1E0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx5Q8K1E0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx5Q8K1E0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx5Q8K1E0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx5Q8K1E0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx5Q8K1E0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx5Q8K1E0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx5Q8K1E0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx5Q8K1E0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stx5Q8K1E0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stx5Q8K1E0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stx5Q8K1E0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx5Q8K1E0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms