Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrif1Q8CDD9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrif1Q8CDD9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrif1Q8CDD9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrif1Q8CDD9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrif1Q8CDD9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrif1Q8CDD9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrif1Q8CDD9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrif1Q8CDD9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrif1Q8CDD9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrif1Q8CDD9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrif1Q8CDD9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrif1Q8CDD9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrif1Q8CDD9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrif1Q8CDD9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrif1Q8CDD9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrif1Q8CDD9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrif1Q8CDD9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrif1Q8CDD9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrif1Q8CDD9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrif1Q8CDD9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrif1Q8CDD9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrif1Q8CDD9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrif1Q8CDD9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrif1Q8CDD9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrif1Q8CDD9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrif1Q8CDD9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrif1Q8CDD9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrif1Q8CDD9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrif1Q8CDD9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrif1Q8CDD9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrif1Q8CDD9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrif1Q8CDD9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrif1Q8CDD9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrif1Q8CDD9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrif1Q8CDD9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrif1Q8CDD9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrif1Q8CDD9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrif1Q8CDD9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrif1Q8CDD9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrif1Q8CDD9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrif1Q8CDD9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrif1Q8CDD9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrif1Q8CDD9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrif1Q8CDD9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrif1Q8CDD9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrif1Q8CDD9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrif1Q8CDD9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrif1Q8CDD9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrif1Q8CDD9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrif1Q8CDD9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrif1Q8CDD9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lrif1Q8CDD9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrif1Q8CDD9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrif1Q8CDD9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrif1Q8CDD9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrif1Q8CDD9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrif1Q8CDD9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrif1Q8CDD9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrif1Q8CDD9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrif1Q8CDD9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrif1Q8CDD9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrif1Q8CDD9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrif1Q8CDD9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrif1Q8CDD9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrif1Q8CDD9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrif1Q8CDD9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrif1Q8CDD9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrif1Q8CDD9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrif1Q8CDD9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrif1Q8CDD9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrif1Q8CDD9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrif1Q8CDD9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrif1Q8CDD9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrif1Q8CDD9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrif1Q8CDD9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrif1Q8CDD9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrif1Q8CDD9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrif1Q8CDD9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrif1Q8CDD9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrif1Q8CDD9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrif1Q8CDD9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrif1Q8CDD9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lrif1Q8CDD9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrif1Q8CDD9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrif1Q8CDD9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrif1Q8CDD9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrif1Q8CDD9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrif1Q8CDD9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrif1Q8CDD9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrif1Q8CDD9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrif1Q8CDD9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrif1Q8CDD9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrif1Q8CDD9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrif1Q8CDD9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrif1Q8CDD9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrif1Q8CDD9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrif1Q8CDD9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrif1Q8CDD9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrif1Q8CDD9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
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