Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp20Q8C6M1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp20Q8C6M1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp20Q8C6M1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp20Q8C6M1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp20Q8C6M1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp20Q8C6M1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp20Q8C6M1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp20Q8C6M1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp20Q8C6M1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp20Q8C6M1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp20Q8C6M1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp20Q8C6M1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp20Q8C6M1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp20Q8C6M1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp20Q8C6M1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp20Q8C6M1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp20Q8C6M1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp20Q8C6M1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp20Q8C6M1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp20Q8C6M1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp20Q8C6M1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp20Q8C6M1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp20Q8C6M1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp20Q8C6M1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp20Q8C6M1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
Usp20Q8C6M1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp20Q8C6M1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp20Q8C6M1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp20Q8C6M1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp20Q8C6M1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp20Q8C6M1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp20Q8C6M1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp20Q8C6M1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Usp20Q8C6M1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp20Q8C6M1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp20Q8C6M1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp20Q8C6M1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp20Q8C6M1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp20Q8C6M1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp20Q8C6M1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp20Q8C6M1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp20Q8C6M1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp20Q8C6M1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp20Q8C6M1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp20Q8C6M1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp20Q8C6M1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp20Q8C6M1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp20Q8C6M1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp20Q8C6M1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp20Q8C6M1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp20Q8C6M1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp20Q8C6M1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp20Q8C6M1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp20Q8C6M1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp20Q8C6M1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp20Q8C6M1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp20Q8C6M1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp20Q8C6M1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp20Q8C6M1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp20Q8C6M1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp20Q8C6M1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp20Q8C6M1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp20Q8C6M1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp20Q8C6M1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp20Q8C6M1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp20Q8C6M1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp20Q8C6M1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp20Q8C6M1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp20Q8C6M1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp20Q8C6M1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp20Q8C6M1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp20Q8C6M1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp20Q8C6M1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp20Q8C6M1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp20Q8C6M1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp20Q8C6M1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp20Q8C6M1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp20Q8C6M1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp20Q8C6M1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp20Q8C6M1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp20Q8C6M1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp20Q8C6M1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp20Q8C6M1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp20Q8C6M1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp20Q8C6M1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp20Q8C6M1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp20Q8C6M1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp20Q8C6M1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp20Q8C6M1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp20Q8C6M1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Usp20Q8C6M1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp20Q8C6M1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp20Q8C6M1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp20Q8C6M1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp20Q8C6M1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp20Q8C6M1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp20Q8C6M1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp20Q8C6M1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp20Q8C6M1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms