Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnot2Q8C5L3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnot2Q8C5L3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnot2Q8C5L3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnot2Q8C5L3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnot2Q8C5L3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnot2Q8C5L3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnot2Q8C5L3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnot2Q8C5L3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot2Q8C5L3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnot2Q8C5L3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnot2Q8C5L3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnot2Q8C5L3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnot2Q8C5L3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnot2Q8C5L3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnot2Q8C5L3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot2Q8C5L3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot2Q8C5L3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot2Q8C5L3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot2Q8C5L3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot2Q8C5L3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnot2Q8C5L3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnot2Q8C5L3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnot2Q8C5L3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnot2Q8C5L3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnot2Q8C5L3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnot2Q8C5L3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnot2Q8C5L3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnot2Q8C5L3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot2Q8C5L3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot2Q8C5L3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot2Q8C5L3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot2Q8C5L3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot2Q8C5L3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot2Q8C5L3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot2Q8C5L3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot2Q8C5L3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot2Q8C5L3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot2Q8C5L3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnot2Q8C5L3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnot2Q8C5L3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnot2Q8C5L3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnot2Q8C5L3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnot2Q8C5L3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnot2Q8C5L3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnot2Q8C5L3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnot2Q8C5L3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnot2Q8C5L3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnot2Q8C5L3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnot2Q8C5L3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cnot2Q8C5L3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnot2Q8C5L3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnot2Q8C5L3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnot2Q8C5L3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnot2Q8C5L3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnot2Q8C5L3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnot2Q8C5L3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnot2Q8C5L3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnot2Q8C5L3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnot2Q8C5L3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnot2Q8C5L3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnot2Q8C5L3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnot2Q8C5L3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnot2Q8C5L3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnot2Q8C5L3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnot2Q8C5L3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnot2Q8C5L3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnot2Q8C5L3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnot2Q8C5L3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnot2Q8C5L3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnot2Q8C5L3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnot2Q8C5L3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnot2Q8C5L3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnot2Q8C5L3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnot2Q8C5L3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnot2Q8C5L3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnot2Q8C5L3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnot2Q8C5L3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnot2Q8C5L3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnot2Q8C5L3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnot2Q8C5L3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnot2Q8C5L3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnot2Q8C5L3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnot2Q8C5L3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnot2Q8C5L3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cnot2Q8C5L3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnot2Q8C5L3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnot2Q8C5L3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnot2Q8C5L3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnot2Q8C5L3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnot2Q8C5L3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnot2Q8C5L3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnot2Q8C5L3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnot2Q8C5L3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnot2Q8C5L3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnot2Q8C5L3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnot2Q8C5L3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnot2Q8C5L3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnot2Q8C5L3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnot2Q8C5L3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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